利用DNA池和测序技术快速筛查SNPs及估算基因频率-华南农业大学.PDFVIP

　遗 传 学 报 　A c ta Gen e tica S in ica , Ap ril 2 005 , 32 (4 ) : 372 ～377 IS SN 0379 - 4 172 R ap id ly S c re en in g SN P s an d E s tim a tin g A lle lic F re q u en c ie s b y DNA P o o lin g a n d S e q u en c in g ① CU I J ia n Xun , DU Ho n g L i , ZHAN G X iQ u a n ( Co lle ge o f An mi a l S c ie n ce , So u th C h in a A g ricu ltu ra l U n ive rs ity , Gu a n gzho u　5 10642 , C h in a ) A b s tra c t: Fo u r b re e d s o f ch icken s (W h ite L e gho rn , Ya ng sh a n , Ta ih e S ilk ie s,W h ite R e ce s s ive Ro ck s) w ith d if fe ren t e gg p ro du c tio n w e re app lie d to sc re en p o te n tia l s in g le nu c leo tide p o lym o rp h ism s ( SN P s) re la te d to rep ro du c tio n tra it in d is ta l p a rt re g io n o f p ro la c tin gen e b a se d o n DNA p oo lin g a n d se qu e n c ing. E igh t SN P s ( C 2402 T, T2 192 C , C 2 16 1G , C 2 134 G , C 2 062 G , G 2 04 0A , A 1944 G a n d C 1884A ) w e re fo un d su cce s sfu lly in th e fra gm e n t o f 1 02 8 bp a t th e d is ta l p a rt o f 5 ′fla nk in g re g io n. M o reo ve r, a s mi p le a n d rap id m e tho d to e s tmi a te a lle lic fre qu e n c ie s o f SN P s in e a ch b re e d by ca lcu la tin g th e ra tio o f a lle le p e a k h e igh ts w a s in tro du ce d h e re. Th e a ccu ra c ie s o f e stmi a tio n fo r th e a lle lic fre qu e n c ie s o f C 24 02 T, C 2 16 1G , C 1884A , C 2 062 G a n d G 2 04 0A w e re ve rifie d by com p a rin g w ith th e re su lts o f PCR R FL P o r PCR S SC P. Ke y w o rd s : DNA p oo lin g; se qu en c ing; s in g le