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使用非线性映射算法.PPT

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临床要求:准确、无创、简便、早期诊断制定治疗方案指导临床分期和监测预后 研究应用新的技术手段与判断方法 构建肾母细胞瘤早期诊断 分期模型及预后模型 蛋白组学的发展为肿瘤诊断提供了新的思维和技术平台 SELDI-TOF-MS特点 高通量(96孔) 可靠的重复性 灵敏度高(1-50fmol) 简便(无需纯化样品) 检测范围广(500Da-500kD) 所需样本体积小(0.5-400ul) 生物信息学技术 树型决定结构 等级分聚类 人工神经网络 支持向量机 支持向量机主要思想 1. 使用非线性映射算法—— 将输入向量映射到高维特征空间 2. 基于结构风险最小化理论—— 在特征空间中建构最优分割超平面 PBS-Ⅱ型SELDI-TOF-MS系统 分析参数: 激光强度为170, 灵敏度为6, 每个样本收集总点数140次; 收集数据范围1000-50000Dal 优化范围2000到20000Dal。 主要试剂 NaNc: 分子量136.0 (上海生工生物工程公司) 脲素: 分子量60.6 (Promega Inc. 美国) 乙腈: 分子量41.05 (Sigma Inc. 美国) CHAPS: 分子量604.9 ( Promega Inc. 美国) SPA: 能量吸收基质 (Ciphergen Inc. 美国) U9缓冲液:9M脲素、 2% CHAPS、1%DTT 50% 饱和SPA,充分振荡5分钟,离心1分钟,再加上等体积的上述混合溶液 肾母细胞瘤各项传统检查符合率 结 论 肾母细胞瘤患儿血清蛋白质标记物 筛出m/z峰值位于6984.0和6455.0的 蛋白质标志物2个 与正常组比较 患儿组此两峰处的蛋白质低表达 (P<0.05) 结 论 24例手术前后血清蛋白质标记物的比较 术前呈低表达或不表达 21例根治术患儿术后2周标本 高表达19例低表达2例 3例姑息性切除患儿手术前后 比较差异无统计学意义 肾母细胞瘤I、II、III、IV期的M/Z的强度 依次降低的,分期愈高其M/Z强度愈低 术中没有彻底切除肿瘤 M/Z强度较低与术前没有明显区别 I期与正常儿童M/Z区别不明显(I期低于健康儿童) M/Z强度愈高,分期愈低,预后愈好 结 论 应用SELDI-TOF -MS技术和SVM方法构建的分期模型 成功区分肾母细胞瘤Ⅲ+Ⅳ期与 肾母细胞瘤Ⅰ期+Ⅱ期患儿 指导临床制定合理的治疗方案 提高治愈率 改善预后 早期诊断灵敏性高,特异性高 无创,简便 结果稳定,不受主观因素影响 分期准确,提高预后,延长生存期 存在问题 SELDI-TOF-MS技术不足之处: 标准化 需要大量样本的验证。 * * 血清蛋白质标记物在肾母细胞 瘤中的临床应用研究 郑州市儿童医院普外科 陈新让 无法满足临床无创、简便、高效、快速的早期诊断及指导治疗和监测预后的要求 肾母细胞瘤诊断现状 B超 彩超 CT 肾动脉造影 MRI IVP 同位素骨扫描 腹部平片 肿瘤细胞的 蛋白质表达谱 生物信息学 基因组表达的整套蛋白质进行分析 正常对照的蛋 白质表达谱 蛋白质组学 多种标志物联合 诊 断 模 型 分 期 模 型 预 后 模 型 临床资料 血 清 样 本 75 例 正常对照20例 其他小儿腹部实体肿瘤25例 肾母细胞瘤100例 神经母细胞瘤9例 肝母细胞瘤5例 胰母细胞瘤2例 腹膜后畸胎瘤5例 (男11例,女14例,平 均年龄3.5岁) (男63例,女57例

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