生物信息学一(究生).pptVIP

信息的特点 信息具有不灭性 信息可以廉价复制,可以广泛传播 信息的价值有很强烈的时效性 生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学 人类基因蓝图不是由孤立的基因和大量“垃圾DNA片段”组成的，而是一个复杂的网络系统，单个基因、调控元件以及与编码蛋白无关的其他类型的DNA序列一道，以交叠的方式相互作用，共同控制着人类的生理活动 . Homology Search Server: GP7000Sm1000 (64cpu x 2 sets) Database Servers: GP7000Sm650 (12cpu) x3 File Server: GP7000Sm550(12cpu) Data Storage Library: PowderHorn Genome Information Server: GP7000Sm350(6cpu) Graphics Server: SGI Onyx3400 Bio Simulation Database Server: SGI Onyx3400 Genome Analysis Server: Decypher D40-B15 Graphics Workstation: SGI Octane2 Desktop Workstation: GP400Sm10 生物学内涵 Bio 表达谱学 - cDNA芯片 - 蛋白芯片 代谢组学 - 代谢的途径 - 疾病发生和发展的途径 基因组学 -测序中的信息分析 新基因和新SNP的发现 非编码区的信息和结构分析 遗传密码的起源和生物进化 比较基因组学研究 蛋白质组学 - 蛋白质结构预测 - 分子药物设计 发展方向 软件和算法 与疾病相关的基因信息及相关算法和软件的开发. 数据库和分子标记 建立动植物良种繁育相关的基因组数据库，发展分子标记辅助育种技术 药物设计 研究与发展药物设计软件和基于生物信息的分子生物学技术 农业 医疗 计算机科学 生物信息学的大科学特点 计算生物学家 实验生物学家 生物信息学的大科学特点 Bioinformatics 生物学 工程学 计算机软硬件技术 数学 * 生物信息学 18年间数据增长近10万倍 核酸序列增长情况 数据增长年代 摩尔定律并非一个物理定律，而是揭示了一个电子产品飞速发展的规律 1995年 人类基因组第一个五年计划结束 生物信息学是一门针对生物、医学、行为和健康方面数据的发掘，而为相关的计算工具及方法进行研究、开发及应用的学科，其研究范畴包括对这些数据的采集、表达、描述、储存、分析和图形显示. 美国卫生部 首次突破万亿浮点性能的ASCI Red使用了一万颗处理器 英特尔于1996年首度达到兆级浮点运算的效能。当时英特尔替美国山地亚(Sandia)国家实验室制作了一台ASCI Red超级计算机，占地超过2,000平方英呎，采用近一万颗Pentium Pro处理器，耗电量超过500千瓦。现在只要一颗多核心英特尔研究用芯片，就能达到同样的效能 运行中的“万亿次”浮点芯片 世界上首款具有万亿次浮点运算性能的可编程处理器，该处理器集成80核心， 超级电脑“尤金（Jugene）” 2008年2月22日，超级电脑“尤金（Jugene）”在德国西部小城尤利希（Juelich）的尤利希研究中心正式投入运行。尤金的运算功能相当于20000台普通PC，将主要用于欧盟的大型研究项目。 “尤金”是由IBM基于“蓝色基因 P”开发的新型运算平台，其浮点运算速度可达167万亿次每秒，相当于20000台现在普通PC的集合。当尤金全速运转时，最高峰值可以达到223万亿次每秒。 美国IBM的“蓝色基因”，位于Lawrence Livermore试验室，运算速度为478万亿次每秒，成为世界上最快的超型计算机，它有213，000颗处理器 美国IBM在超级计算机上仿佛吃了一剂强兴剂，猛的提高这么多... Two of the women who worked on ENIAC, Frances Bilas and Elizabeth Jennings with a portion of the giant which weighed 30 tons and had to be manually programmed by over 200 operators Penn President Judith Rodin with Vice President of the United States Al Gore, Jr. who was honorary chair for ENIACs 50th anniversary celebration, February 14, 1996.