新一代测序技术无创产前检测胎儿FGFR3基因突变-解放军医学院学报.PDF

14 解放军医学院学报 Acad J Chin PLA Med Sch Jan 2017，38（1） 新一代测序技术无创产前检测胎儿FGFR3 基因突变 任　远，高　雅，卢彦平，赵　佳，李芮冰，刘弘泰，姜淑芳，谢一帆，周红辉，游艳琴，孟元光 解放军总医院 妇产科，北京　100853 摘要 ：目的 探讨新一代测序技术 (next-generation sequencing，NGS) 无创产前筛查 FGFR3 相关疾病的可行性与准确率。 方法 4 例软骨发育不全、2 例致死性侏儒Ⅰ型胎儿基因组 DNA(gDNA) 片段化后，以相应母体产后血浆游离 DNA 为背景， 按照 10%、6%、3%、1%、0.5% 的浓度进行稀释，形成 30 例阳性模拟样本，建立孕妇血浆游离 DNA 模型，同时采集 13 例阴性对照孕妇血浆游离 DNA，运用 NGS 技术分别检测 FGFR3 致病突变位点，计算检测灵敏度、特异度、阳性预测 值、阴性预测值。 结果 30 例模拟样本中，胎儿 gDNA 浓度为 10%、6%、3%、1%、0.5% 时，突变检出例数分别为 6/6、 6/6、6/6、3/6、1/6，13 例阴性突变检出例数为 0/13 ；胎儿 gDNA 浓度≥ 3% 时，NGS 的灵敏度为 100%(95% CI ：81.5% ~ 100%)，特异度为 100%(95% CI ：75.3% ~ 100%)，阳性预测值为 100%(95% CI ：81.5% ~ 100%)，阴性预测值为 100%(95% CI ：75.3% ~ 100%)。结论 胎儿 gDNA 浓度≥ 3% 时，NGS 可以在孕妇血浆游离 DNA 模型中准确检出胎儿 FGFR3 基因突变， 提示基于 NGS 技术的无创产前检测在新发突变或父源遗传疾病的产前诊断领域具有一定的应用前景。 关键词 ：新一代测序技术 ；无创产前检测 ；胎儿游离 DNA ；软骨发育不全 ；FGFR3 基因 中图分类号 ：R 714.5　文献标志码 ：A　文章编号 ：2095-5227(2017)01-0014-06　DOI ：10.3969/j.issn.2095-5227.2017.01.004 网络出版时间：2016-12-02 15:08　　　 网络出版地址 ：/kcms/detail/11.3275.R1508.002.html 　 Accuracy and feasibility of non-invasive prenatal testing for FGFR3-related skeletal dysplasia by next-generation sequencing REN Yuan, GAO Ya, LU Yanping, ZHAO Jia, LI Ruibing, LIU Hongtai, JIANG Shufang, XIE Yifan, ZHOU Honghui, YOU Yanqin, MENG Yuanguang Department of Obstetrics and Gynecology, Chinese PLA General Hospital, Beij ing 100853, China Corresponding author: MENG Yuanguang. Email: meng6512 @ Abstract: Objective To explore the test accuracy and feasibility of non-invasive prenatal testing for FGFR3- related skeletal dysplasia based on next-generation sequencing (NGS). Method Fragmented fetal genome DNA (gDNA) of achondroplasia (n=4) or thanatophoric dysplasia type Ⅰ (n=2) were diluted by corresponding post-delivery maternal cell-free DNA into different concentrations including 10%, 6%, 3%, 1% and 0.5% (n=30). Cell-free DNA collected from pregnant women (n=13) whose fetuses were confir