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教學日誌
第 PAGE 4 頁
銘傳大學生物科技學系
教學日誌
九十六學年度 第二學期
課程名稱:39314 生物資訊學二[必修]
上課班級:39302 生科三乙
編號:96TB-39314-a02
授課教師:李御賢
課程名稱:生物資訊學二(三乙) 日誌編號:96TB-39314-a02
授課日期:2008/2/20
授課教師:李御賢 出席學生: 55/55
授課內容摘要
課程進度:Molecular biology and biological chemistry
課程內容重點:分生簡介
評量:到NCBI download 序列資料,全班同學的要download的gene序列資料是不一樣,以防止同學抄襲。同學上傳結果到ftp站
PLD1
Homo sapiens mRNA for phospholipase D1 variant protein.
NM_002662
cttgttagcccacagcctgtaatagaatggacagatgccaccctagttgtgtcttaagaa
MPWHDIASAVHGKAARDVARHFIQRWNFTKIMKSKYRSLSYPFLLPKSQTTAHELRYQVP
。
作業:
Q1. 說明 DNA 與 RNA 的不同? (Sketch the chemical structures of DNA and RNA).
Q2. What is the complementary sequence of 5-GGATCGTAGCCTA-3’
Q3. Diagram the “central dogma” of molecular biology in 真核細胞 and in 原核細胞.
Q4. 真核細胞的 Gene structure 包括 Promoter, intron, exon, terminator, 分別說明之.
Q5. 真核細胞的 mRNA processing包括Capping, PolyAdenylation, RNA splicing分別說明之.
Q6. 說明的Primary, Secondary, Tertiary and Quaternary Structure of Protein structure.
Q7. (a) 化學鍵可分為:共價鍵、離子鍵及金屬鍵三大類,說明之.
(b) 物理鍵包括氫鍵與凡得瓦爾力,說明之.
(c)比較上述各鍵能之大小.
Q8.說明 Radiocarbon dating 的原理.
Q9. How does a cDNA library differ from a genomic library?
Q10. A circular piece of DNA known to be 4000 bp long is cut into two pieces when treated with the restriction enzyme EcoRI: One pieces is 3000 bp long and the other is 1000 bp long. Another restriction enzyme, BamHI, cuts the same DNA molecule into three pieces of the following lengths: 2500, 1200 and 300 bp. When both EcoRI an BamHI are used to cut the DNA molecule together, fragments of the following sizes are generated: 1600, 1200, 900, 200, and 100 bp. Use this information to make a restriction enzyme map of this circular DNA molecule,
回應:none
記錄者:李御賢 教師:李御賢
課程名稱:生物資訊學二(三乙) 日誌編號:96TB-39314-a02
授課日期:2008/2/27
授課教師:李御賢 出席學生: 55/55
授課內容摘要
課程進度:Data Searches and Pairwise Alignments
課程內容重點:Fetch sequences and Dot plot的分析
評量:到NCBI download 序列資料,包括exon,intron的資料,全班同學的要download的gene序列資料是不一樣,以防止同學抄襲。同學上傳結果到ftp站。
NM_003753
GGGAGAGCAGTTTACGACAGCGCCGGTCGTGTT
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