江苏克氏原螯虾典型群体遗传多样性微卫星分析-渔业专业论文.docxVIP

上海海 上海海洋大学硕士学位论文 万方数据 万方数据 上海海洋大学学位论文原创性声明 本人郑重声明：我恪守学术道德，崇尚严谨学风。所呈交的学位论文，是本 人在导师的指导下，独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经明确注明和引 用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品及成果 的内容。论文为本人亲自撰写，我对所写的内容负责，并完全意识到本声明的法 律结果由本人承担。 学位论文作者签名： 日期： 年 月 日 上海海洋大学学位论文版权使用授权书 学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保 留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅或借 阅。本人授权上海海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据 库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。 本学位论文属于 保密 □ ，在 年解密后适用本版权书。 不保密 □ 学位论文作者签名： 指导教师签名： II日期： 年 月 日 日期： 年 月 II 江苏克氏原螯虾典型群体遗传多样性微卫星分析 摘 要 克氏原螯虾(Procambarus clarkii)是我国重要的淡水经济甲壳类之一，江苏省 是我国克氏原螯虾的主要养殖省份之一。克氏原螯虾种质资源的研究对其保护和 利用、提高养殖产量、良种选育等具有重要意义。本研究共收集了江苏9个克氏 原螯虾天然群体（太湖群体3个、洪泽湖群体3个、骆马湖群体1个、固城湖群体1 个，长江江心镇群体1个）与1个克氏原螯虾圈养群体（盱眙满江红群体）。开发 了12个克氏原螯虾的EST-SSR标记，分析了这些克氏原螯虾群体的遗传多样性和 遗传结构，主要内容如下： 1. 克氏原螯虾EST-SSR标记筛选与分析 筛选出12个克氏原螯虾微卫星标记，对60个克氏原螯虾基因组DNA进行扩 增并分析其多态性水平，结果显示：12对多态性微卫星标记的等位基因数在3~9 之间，平均观测杂合度为0.556，平均期望杂合度值为0.745。经Bonferroni校正后， 12个位点均偏离Hardy-Weinberg平衡，多态信息含量（PIC)介于0.509~0.875之间， 所有位点均为高度多态位点，可较好地分析遗传结构和多样性，这些标记用于克 氏原螯虾遗传多样性分析效果较好。 2. 池塘圈养对克氏原螯虾遗传多样性的影响 选用 8 个微卫星标记研究了盱眙满江红圈养群体、洪泽湖西顺河天然群体及 长江江心镇天然群体的遗传多样性，研究表明：8 对微卫星引物在 3 个克氏原螯 虾群体中共得到 48 个等位基因，8 个群体有 23 个位点经 Bonferroni 法校正后均 显著偏离 Hardy-Weinberg 平衡且绝大多数位点显示杂合不足。3 个群体中长江江 心镇群体的遗传多样性水平最高，盱眙满江红群体的遗传多样性水平最低。群体 间遗传分化指数 FST 及 AMOVA 分析表明，3 个群体遗传分化指数为 0.036，存 在低等程度的分化（FST＜0.05）。基于遗传距离构建的 UPGMA 聚类树显示，洪 泽湖西顺河群体与长江江心镇群体聚为一支，盱眙满江红群体自成一支。总体而 言，三个群体遗传多样性较高且无显著差异，天然群体与圈养群体间存在一定的 遗传分化。 3. 江苏 8 个克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析 利用克氏原螯虾8个微卫星标记分析了江苏省8个天然克氏原螯虾群体，包 括：太湖群体3个（大浦、平望、漆塘）；洪泽湖群体3个（官滩、西顺河、太平）； 固城湖群体1个（固城）；骆马湖群体1个（洋河滩）的遗传多样性。研究表明： I 8个群体全部64个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且 绝大多数位点显示杂合不足。8个群体中遗传多样性水平大浦群体最高，平望群 体最低。遗传分化指数FST及AMOVA分析表明，8个群体遗传分化指数为0.126， 存在中等程度的分化（0.05＜FST＜0.15）。基于遗传距离构建的UPGMA聚类树 显示，8个群体可分为4组：平望群体、漆塘群体和大浦群体聚为一组，太平群体、 西顺河群体与官滩群体聚为一组，而固城群体、洋河滩群体分别自成一组。江苏 克氏原螯虾遗传多样性较高，各群体间存在中低度的遗传分化，克氏原螯虾种群 显示了极强的杂合子缺失，人为捕捞可能是造成其杂合子缺失的主要原因。遗传 分化指数与地理距离呈显著正相关(r = 0.334, P 0.05)。 关键词：江苏，克氏原螯虾，遗传多样性，微卫星 II Genetic diversity analysis of typical Procambarus clarkii stocks in Jiangsu based on microsatellite ABSTRACT Procam