桃已知MADS．box转录因子的生物信息学及花发育表达分析.PDFVIP

核 农 学 报 2015，29(5)：0849～0858 JournalofNuclearAgriculturalSciences 文章编号 ：1000—8551(2015)05—0849—10 桃 已知 MADS．box转录因子的生物信息学 及花发育表达分析 王传增 余贤美 董庆龙 张安宁 刘 伟 董 飞 王淑贞 王长君 ( 山东省果树研究所 ，山东 泰安 271000；中国农业科学院果树研究所 ， 辽宁 兴城 125100；山东种业集团股份有限公司 ，山东 济南 250100) 摘 要：MADS—box基 因家族是研究最广泛的植物转录因子之一，参与调控植物生长和发育的多个过程。 本文列举 了当前 已知的MADS．box(PpMADS)基 因在桃 (Prunuspersica)功能基 因组数据库 中的基本信 息，对 PpMADS基 因的保守结构域 、进化关系、内含子与外显子 、染色体 定位和保 守元件进行 了详细分 析 ；并利用半定量 RT．PCR技术分析 了其在不同花器官中和的花的不 同发育阶段表达水平。结果表 明， PpMADS在桃不同花器官、花不同发育期 中起重要的调控作用，为进一步筛选 PpMADS基 因进行功能分 析奠定相 关理论基础 。 关键词：桃 ；MADS—box；基 因组学；生物信息学分析 ；表达分析 DOI：10．11869／i．issn．100．8551．2015．05．0849 MADS—box基 因家族起初被鉴定为 同源异 型基 之间的区别是 MIKC 不含有 I区域和保 守性相对较 因，是植物界中研究最为广泛的转录因子家族 ，它在植 低的K盒。在水稻中，根据其进化关系 MIKC可被进 物营养生长及生殖生长过程 中起着关键的调控作用。 一 步分为 12个亚组 ，同时在植物生长和发育过程 MADS．box基 因在其 N末端 区域含有一段约为 60个 中，MIKC也是研 究 的最为透彻 的一个类 型 ’ 。相 残基 的保守氨基酸序列 ，称之为 MADS-box区域 ，负责 对于 TypeII，TypeI的结构 比较简单并且缺乏 K盒。 绑定 目的基因中调控区域的CArG盒子 I2。 类型 I根据进化关系也可进一步分为 4种类型 ：Ma、 植物 MADS．box基因家族根据进化关系可以分为 MI3、My和 M8 。 2种类型：TypeI和TypeII。TypeII含有4个保守域 ， MADS．box基因家族在植物发育的多个过程 中都 又被称为 MIKC类型 ：MADS(M)盒 、Intervening(I)区 起到重要的调控作用 ，其 中最为著名 的是 ABC模型， 域、Keratin(K)盒和 C-terminal(C)末端 。I区域位 它是根据模式植物金鱼草和拟南芥 的研究提 出来 于 MADS盒和 K盒之间，由31～35个氨基酸组成 ，含 的 ¨ ，随着近年来研究的不断深入，现提出了ABCDE 有多个亲水残基的非保守序列 ，负责绑定特异性二聚 模型来解释花形成的调控。ABCDE模型认为 ：A和 E 体与 DNA，组合为复合体 ；K盒由约为 70个氨基酸 类基因调控萼片的发育；A、B和 E类基 因共 同调控花 组成 ，是植物 MADS-box转录因子的特征序列 ，参与到 瓣 的发育 ；B、C和 E类基 因共同调控雄蕊的发育 ；C和 蛋白与蛋 白互作过程 ；C末端位于 K盒下游 ，是 由 E类基因调控心皮的发育；D和 E类基 因调控胚珠的 约30个氨基酸组成的并富含疏水残基 的非保守区域 ， 发育 ¨卜圯’。在拟南芥 中，A类基 因包括 APETALA1 负责转录激活 。根据其结构特征，MIKC类型又可 (AP1)；B类基 因包括 PISTILATA(P，)和 AP3；C类基