表达模式分析.PDF

中国农学通报 2019,35(6): 101-107 Chinese Agricultural Science Bulletin 不同水稻品种OsVDAC3及3个互作蛋白基因OsV3IP1-3 表达模式分析 王亚楠，程 钢，覃永华，谭艳平，刘学群，徐 鑫，刘新琼，王春台 （中南民族大学生命科学学院，生物技术国家民委重点实验室， 武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室，武汉430074 ） 摘 要：为研究OsVDAC3 及互作蛋白基因OsV3IP 1-3 的表达模式，用生物信息学和定量PCR 方法分析 了水稻不育系‘粤泰A ’(YTA)、保持系‘粤泰B ’(YTB)和‘日本晴’(NIP)不同发育时期幼穗，四叶期根、鞘 和叶中OsVDAC3 和OsV3IP 1-3 的表达量。生物信息学分析表明在ATG 上游含有21 个与水稻生长发育 及胁迫应答相关的顺式作用元件；RiceXPro 和MSU Rice Genome Annotation Project 水稻基因表达数据 库分析结果表明在NIP 中OsV3IP 1 只在幼苗表达，而OsVDAC3、OsV3IP2 和OsV3IP3 在整个生活周期 都表达，但OsVDAC3 在花药表达水平最高，OsV3IP2 在生殖器官表达水平最高，OsV3IP3 在嫩芽中表达 量最高。定量PCR 结果表明OsVDAC3 和OsV3IP 1-3 基因在NIP 、YTA 和YTB 3 个水稻品种中表达模式 不同。OsVDAC3 在YTB 的1.5~4.0 cm 幼穗表达水平非常高，OsV3IP 1在3 个品种的四叶期地上部都有 非常高的表达，OsV3IP2 和OsV3IP3 在YTB 和NIP 中表达模式相似，而与YTA 中差异明显。这些基因 的表达模式与功能的关系有待进一步研究。 关键词：水稻；OsVDAC3 ；OsV3IP 1-3 ；表达模式 中图分类号：Q78 文献标志码：A 论文编号：cas OsVDAC3and3InteractionProteinGenesOsV3IP1-3inRiceCultivars:ExpressionPatternAnalysis WangYanan,ChengGang,QinYonghua,TanYanping,LiuXuequn,XuXin,LiuXinqiong,WangChuntai (KeyLaboratoryofStateEthnicAffairsCommissionforBiologicalTechnology,HubeiProvincialKeyLaboratoryforProtectionand ApplicationofSpecialPlantsinWulingAreaofChina,South-CentralUniversityforNationalities,Wuhan430074) Abstract: To studytheexpressionpatternsof OsVDAC3 anditsinteractionproteingene OsV3IP1-3,the expressionof OsVDAC3and OsV3IP1-3intheinflorescencesofdifferentdevelopmentalstagesandtheroot, sheathandleafatthefourth-leafstagefromthericesterileline ‘YuetaiA’(YTA),themaintenanceline ‘YuetaiB’(YTB)and ‘Nipponbare’(NIP)wereanalyzedwithbioinformaticsandRT-PCR.Theresultsof bioinformaticsanalysisshowedthattherewere 21 Cis-actionelementsrelatedwiththegrowthandstress responseofriceintheupstreamofATG.Theanalysisresultsof