siRNA表达载体的构建-V1.docxVIP

siRNA表达载体的构建 siRNA表达载体构建可以：（1）作为后基因组时代基因功能分析的有力工具；（2）应用于基因组学、细胞信号传导通路分析；（3）用于药物靶点筛选、疾病治疗。 实验方法原理: 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpinRNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA polIII启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表达更多的小分子RNA，而且它是通过添加一串（3到6个）U来终止转录的。要使用这类载体，需要订购2段编码短发夹RNA序列的DNA单链，退火，克隆到相应载体的pol III 启动子下游。由于涉及到克隆 ，这个过程需要几周甚至数月的时间，同时也需要经过测序以保证克隆 的序列是正确的。 实验材料: 目的基因 试剂、试剂盒： LB培养基 仪器、耗材： 离心管、离心机、水浴锅、漩涡振荡仪等 实验步骤： 一、目的基因的确定 1. 检索文献获取有实验证明有效的靶点序列（核对）。 2. NCBI查阅：/。 3. 搜索引擎辅助：/ or 。 二 、设计siRNA靶序列 在制备siRNA 前都需要单独设计siRNA序列.研究发现对哺乳动物细胞,最有效的siRNAs是21-23个碱基大小、3’端有两