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Replication and damage repair
;第一节 DNA的复制(Replication, DNA biosynthesis);
(一)半保留复制
DNA在复制时,以亲代DNA的每一股作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制(semi-conservative replication)。;DNA以半保留方式进行复制,是在1958年由M. Meselson 和 F. Stahl 所完成的实验所证明。该实验首先将大肠杆菌在含15N的培养基中培养约十五代,使其DNA中的碱基氮均转变为15N。将大肠杆菌移至只含14N的培养基中同步培养一代、二代、三代。分别提取DNA,作CsCl密度梯度离心.
;(以原核生物 大肠杆菌为例)
原料: dNTP,Mg++
双链DNA模板
引物(primer),常是RNA,有游离的 3’OH。
引物酶(primase,DnaG),用于合成复制所必需的RNA引物
解螺旋酶 ( helicase ) , DnaB, 由DnaA和DnaC协助在复制的起始点(Ori C)上解开双螺旋。;复制的起始点与方向;E.coli复制起始点oriC跨度为245bp,包括两个关键序列:13bp的序列和9bp序列,它是决定和控制E.coli染色体复制的唯一片段。 ; 9bp重复序列,重复出现4次,能与起始蛋白dnaA特异结合,当dnaA蛋白(约20种)结合于ori的4个部位上时复制开始。 dnaA蛋白(一种专一的蛋白)和ori结合后,双螺旋解开形成复制叉。故dnaA蛋白与启动解链有关,dnaA蛋白是起始的关键成分。;大肠杆菌复制起点成串排列的重复序列;复制方向;复制中的大肠杆菌染色体放射自显影图(Caims实验);;多个起始点;二、 DNA复制的酶学;一、复制的化学反应;二、 解链相关酶类; DNA解旋酶(helicase)(解链酶)
功能:DNA的双螺旋解链(解DNA双链),解开一对碱基,需2分子ATP,
作用点:DNA上局部单链处,向双链方向解链。
种类:E.coli有四种解螺旋酶,I、II、III和rep蛋白。 I、II、III中任一种沿模板5-3 方向移动,rep蛋白沿模板3 -5方向移动。;2. 拓扑异构酶(Topo); 首先在大肠杆菌中被发现,它可使DNA的一条链发生断裂和再连接,反应无需供给能量。 另外,DNA复制时负超螺旋的消除,亦由拓扑异构酶Ⅰ来完成,但它对正超螺旋无作用。; 由两个A亚基和两个B亚基组成,即A2B2。它能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入负超螺旋以消除复制叉前进带来的扭曲张力时,需要由ATP提供能量。 两种拓扑异构酶在DNA复制、转录和重组中均发挥重要作用。;拓扑异构酶 I 抑制剂:喜树碱类
拓扑异构酶 II 抑制剂:依托泊苷,多柔比星,阿霉素类等;3. 单链DNA结合蛋白(SSB);三、DNA聚合酶(DNA-pol)
即依赖于DNA的DNA聚合酶(DDDP) ;DNA聚合酶功能;大肠杆菌三种DNA聚合酶比较;四、引物酶(Primase)和引发体;DnaA;
;第三节 DNA生物合成过程;一 复制的起始;(二)引发体的生成;(三) RNA引物的合成;参与复制起始的蛋白因子;领头链的合成;复制过程简图;;二、真核生物DNA生物合成;; 1.端粒telemer:指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构。
2.结构特点:
(1)由末端单链DNA序列和蛋白质构成。
(2)末端DNA序列是多次重复的富含G、C碱基的短序列。; 3.功能:
(1)维持染色体的稳定性
(2)维持DNA复制的完整性
4.端粒酶:由RNA和蛋白质组成
(1)RNA发挥模板作用
(2)蛋白质发挥逆转录酶活性;端粒酶的催化延长作用;DNA聚合酶复制子链; 引物合成后,由DNA polⅢ(在真核细胞为DNA聚合酶?和?)催化,按碱基配对原则,将dNTP逐一添加到引物3’ 末端,形成磷酸二酯键,使新合成的链不断延长 ;;(三)终止阶段;半不连续复制(semi-discontinuous replication); 基因组能独立进行复制的功能单位称为复制子
(replicon),每个复制子都含有控制复制起始的起点
(origin),可能还有终止复制的终点(terminus)。每个起
始点产生两个移动方向相反的复制叉,复制完成时,复
制叉相遇并汇合连接。习惯上把两个相邻起始点之间的
距离定为一个复制子。; DNA复制时,以复制起始点为中心,向两
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