API鉴定系统在食品微生物学检验中的应用.docxVIP

API鉴定系统在食品微生物学检验中的应用.docx

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API鉴定系统在食品微生物学检验中的应用 宋嵩文(广西玉林食品药品检验所 广西玉林 537000) 【摘要】目的 提高对API鉴定系统的认识及应用。方法 了解API鉴定系统的 基木原理,掌握实际应用的操作要点。结果 API鉴定系统提高了致病菌的检 出水平和准确性,简化操作程序,对日常的检验工作具有很现实的指导意义,值 得推广。 【关键词】API鉴定系统微牛物检验细菌分型技术 【中图分类号】R155.5 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752 (2012) 16-0084-03 API是Analytic Products INC的简称。API鉴定系统是由法国牛物一梅里 埃公司牛产的细菌数值分类分析鉴定系统。该系统品种齐全,包扌舌的范围广,鉴 定的能力强,数据库在不断地完善和补充,目前约有1000种生化反应,可鉴定 的细菌大于550种。是世界范围内应用最广、种类最多、最受微生物学家推崇的 国际标准化产品。被许多国家和组织列入标准方法中[1]。目前在我国各级疾病 预防控制机构、食品、药品、化妆品和临床微生物检验中也比较多地应用此项技 术,但在实际应用中由于对基木原理及产品性能的不了解,在使用中经常出现一 些问题。木文拟就API鉴定系统的原理、使用中的一些常见问题作一介绍。 1 API鉴定系统的原理[2] 1.1数据库API系统用于细菌鉴定的品种有15种,分别有相应的数据 库。数据库由细菌条目(taxa)组成,每个条目可能因情况的不同代表细菌种、 细菌的生物型、细菌的菌属。鉴定主要依据API试剂条的生化反应结果将一种/ 组细菌与其它细菌相鉴别,并用%id (鉴定百分率)表示每种细菌的可能性。 1.2数值鉴定的基木原理 数值鉴定是通过出现频率的计算来进行的, 即每个细菌条目对API系统中每个牛化反应出现频率总和的比较。 1.2.1出现频率的计算,将记录成阳性或阴性的结果转换出现频率。 若为阳性,用100除。 若为阴性,先用100除,再用1减去此商数。 若百分率是0或100,则频率用近似值0.01或0.99代替。 1.2.2在每一个细菌条目中,将所有测定项目的出现频率相乘,得出每 一个细菌条目的总出现频率,每个分类菌群中的所有菌的总出现频率相加为多项 总发生频率。 1.2.3每一个细菌条目的总出现频率被多项总发生频率相除后,乘以 100得到单项鉴定百分率,即%ido全体鉴定百分率之和应等于100。 1.2.4在每个菌群中,再按%id值的大小顺序重新排列。 1.3编码一从生化反应谱到数码谱 各类API试剂条均由多个生化反应 组成,编码即是将生化反应谱转换成数码谱,以便于使用生化反应检索手册或 API电脑分析软件进行检索,确定生化反应谱对应的是什么细菌。编码的原则是 将所有的项目,每3个分为一组,每组按其位置,第1位阳性时标记为1,第2 位阳性时标记为2,第3位阳性吋标记为4,所有阴性反应均标记为0,再将每 组标记的数字相加成一个数字,结果可能是0?7中的任一数字。这样可将鉴定 条的生化反应谱编码成-组7?10位的数码谱。 以API 20E为例,鉴定条总共有20个生化反应,附加氧化酶实验组成 21个实验,编成7组。如某一未知菌通过编码得出的数码谱为5144512,使用 API 20E生化反应检索手册或API电脑分析软件进行检索,可确定该未知菌为大 肠埃希氏菌。 有些情况下,如一个编码下有几个菌名的,7位数字尚不足以分辨,还 需要做一些补充实验,补充实验的项目根据具体情况而定。如硝酸盐还原成亚硝 酸盐(NO)、硝酸盐还原成氮(Nz)、动力(MOB)、麦康凯琼脂上生长(McC)、葡萄糖 氧化(OF?0)、葡萄糖发酵(OF—F)等。 1.4查码一从数码谱到细菌名称查码就是使用生化反应检索手册或 API电脑分析软件进行检索,以确定未知菌为何种细菌的过程。下面是检索手册 或软件中有关内容的解释。 一个编码中只有一个菌名吋,很容易确定是何种细菌。 1.4.2如有几个菌名吋,则按以下方法判断。 第1个菌名的%idge;80.0CI寸,未知菌被鉴定在该条目中,结 合豹(1值的大小及T值对鉴定的可信度做出评价如下: %idge;99.9 Tge;0.75 为极好的鉴定 99.8le;%idle;99.0 Tge;0.75 为很好的鉴定 90.9le;%idle;98.9 Tge;0.25 为好的鉴定 80.0le;%idle;89.9 Tge;0 为可接受的鉴定 %idlt;80为低分辨率 如果第1个菌名的%idlt;80,可将前两个菌的%诃加在一起。 如还不足80,可将前3个菌的%id加在一起,如前3个菌的%id加在一起仍t;80, 则该结果是“不可接受的”。如其和超过80,则有两种可能:一种情况是“鉴定 到种水平”,这必须是这几个加在一起的条目

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