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- 2019-03-08 发布于江苏
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《功能基因与调控》试题
顺式作用元件与反式作用因子有什么区别?
1.1顺式作用元件
存在于基因 HYPERLINK /view/3851917.htm \t /view/_blank 旁侧与结构基因 HYPERLINK /view/659543.htm \t /view/_blank 串联地特定 HYPERLINK /view/1009438.htm \t /view/_blank DNA序列,是转录因子地结合位点,它们通过与转录因子结合而调控基因转录地精确起始和转录效率.顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,要与 HYPERLINK /view/299734.htm \t /view/_blank 反式作用因子相互作用而起作用. HYPERLINK /sowiki/%E9%A1%BA%E5%BC%8F%E5%85%83%E4%BB%B6?prd=content_doc_search \o 顺式元件 顺式元件可分为以下四种 HYPERLINK /sowiki/%E7%B1%BB%E5%9E%8B?prd=content_doc_search \o 类型 类型:①核心启动子成分,如 HYPERLINK /sowiki/TATA%E6%A1%86?prd=content_doc_search \o TATA框 TATA框;②上游启动子成分,如CAAT框,GC框,ATF结合位点;③远上游元件:如增强子,沉默子等;④特殊启动子成分:如 HYPERLINK /sowiki/%E6%B7%8B%E5%B7%B4%E7%BB%86%E8%83%9E?prd=content_doc_search \o 淋巴细胞 淋巴细胞中地Oct和KB.这些元件都为不同地转录因子及蛋白质识别和结合来调节转录.b5E2RGbCAP
1.2反式作用因子
反式作用因子是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率地蛋白质.大多数真核转录调节因子由某一基因表达后,可通过另一基因地特异地顺式作用元件相互作用,从而激活另一基因地转录,这种调节蛋白称反式作用因子.反式作用因子通过以下不同地途经发挥调控作用:①蛋白质和DNA相互作用;②蛋白质和配基结合;③蛋白质之间地相互作用以及蛋白质地修饰.参与基因表达调控地因子,它们与特异地靶基因地顺式元件结合起作用.编码反式作用因子地基因与被反式作用因子调控地靶序列(基因)不在同一染色体上.p1EanqFDPw
反式作用因子有两个重要地功能结构域:DNA结合结构域和转录活化结构域,它们是其发挥转录调控功能地必需结构.反式作用因子可被诱导合成,其活性也受多种因素地调节.同一类序列特异性地反式作用因子由多基因家族所编码.与转录水平调节地反式作用因子通常可分为四大类:①RNA聚合酶;②和RNA聚合酶相联系地普遍性转录因子,它们结合在靶基因地启动子上,形成前起始复合物,DXDiTa9E3d
启动基因地转录;③特异性转录因子(如激活因子和抑制因子),一类与靶基因启动子和增强子(或沉默子)特异结合地转录因子,具有细胞及基因特异性,可以增强或抑制靶基因地转录;④种类多样地协调因子,要么改变局部染色质地构像(如组蛋白酰基转移酶和 HYPERLINK /sowiki/%E7%94%B2%E5%9F%BA%E8%BD%AC%E7%A7%BB%E9%85%B6?prd=content_doc_search \o 甲基转移酶 甲基转移酶),对基因转录地起始具有推动作用,或直接在转录因子和前起始复合物之间发挥桥梁作用(如中介因子(Mediator)),推动前起始复合物(PIC)形成和发挥作用.包括:1.DNA结合域:a.螺旋-转角-螺旋;b.锌指结构;c.亮氨酸拉链d.螺旋-突环-螺旋;2.转录激活域:与其他转录因子相互作用地结构成分.随着表观遗传学地发展,研究发现除了蛋白,DNA、RNA也有调控功能,所以现在也称反式调控元件,主要有miRNA,转录因子等.RTCrpUDGiT
请分别设计研究顺式作用元件、反式作用因子以及两者之间相互作用地实验.?
2.1全长启动子序列获得
premier 5.0 walking技术
提取RNA-反转生成 cDNA-引物设 5’和3’侧翼序列
(包括启动子)
2.2生物信息学分析与预测
获得启动子序列后, 首先通过生物信息学方法对
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