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生物信息(bioinformation)数据库大全
摘要:?[生物信息(bioinformation)数据库大全] http: smartli77 cctrblog net cmd html?do=blogsid=548uid=1511 生物信息(bioinformation)数据库 一.数据库目录 2000年,出版《核酸研究》的牛津大学出版社设立了一个数据库目录网页,这个网页把数据库分成18类在郝柏林、张淑誉编著的《生物信息(bioin…… [关键词:数据库 序列 基因 基因组 蛋白质 蛋白质序列 基因图谱]……关键词:? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%CA%FD%BE%DD%BF%E2 \t /lifesciences/_blank 数据库? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%D0%F2%C1%D0 \t /lifesciences/_blank 序列? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%BB%F9%D2%F2 \t /lifesciences/_blank 基因? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%BB%F9%D2%F2%D7%E9 \t /lifesciences/_blank 基因组? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%B5%B0%B0%D7%D6%CA \t /lifesciences/_blank 蛋白质? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%B5%B0%B0%D7%D6%CA%D0%F2%C1%D0 \t /lifesciences/_blank 蛋白质序列? HYPERLINK /index.php?m=contentc=taga=liststag=%BB%F9%D2%F2%CD%BC%C6%D7 \t /lifesciences/_blank 基因图谱
/cmd.html?do=blogsid=548uid=1511
HYPERLINK / \t /lifesciences/_blank 生物信息(bioinformation)数据库
一.数据库目录
2000年,出版《核酸研究》的牛津大学出版社设立了一个数据库目录网页,这个网页把数据库分成18类在郝柏林、张淑誉编著的《 HYPERLINK / \t /lifesciences/_blank 生物信息(bioinformation)学手册》中,他们进行了合并,又把数据库目录、农林牧有关数据库、医学数据库和文献单独列出,分成以下16类:
1.数据库目录
2.综合数据库包括DNA序列阵:EMBL、GenBank、DDBJ、GSDB、TDB和UniGene
3.DNA序列数据库主要是与基因结构和认定有关的数据库,如密码子使用频度表、真核生物启动子库、内含子和外显子库等
4.RNA序列和核糖体数据库
5.基因图谱数据库
6.人类基因组数据库
7.其他物种基因组数据库
8.基因表达数据库
9.基因突变、病理和免疫数据库
10.蛋白质序列数据库
11.蛋白质结构数据库
12.比较基因组学(comparative genomics)和蛋白质组学(Proteomics)数据库
13.代谢途径和细胞调控数据库
14.与农林牧有关数据库
15.医学数据库
16.其他数据库
二.综合数据库
INSD,国际核酸序列数据库(International Nucleotide Sequence Databank)由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护
EMBL库,欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA 序列库
http://www.ebi.ac.uk/embl.html
GenBank ,美国国家生物技术信息中心 (NCBI)所维护的供公众自由读取的、带注释的DNA序列的总数据库
/Web/Genbank/
DNA Databank of Japan (DDBJ) ,日本核酸数据库
http://www.ddbj.nig.ac.jp/
GSDB是由美国国家基因组资源中心(NCGR)维护的DNA序列关系数据库(Genome Sequence DataBase)
/gsdb/
TIGR DATAbase,是世界上最大的cDNA数据库,还有大量的EST序列和人类基因索引(HGI)
/tdb/hcd/overview.html
三.DNA序列和结构数据库
包括与DNA的复制、转录、修复等有密切关系的蛋
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