丹参ERF基因组序列克隆与多态性分析Cloningandpolymorphism.PDF

1188 药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 2010, 45 (9) : 1188 1193 丹参ERF 基因组序列克隆与多态性分析 崔光红, 冯 华, 李文渊, 汪婉宜, 黄璐琦* ( 中国中医科学院中药研究所, 北京 100700) 摘要: 乙烯应答因子结合蛋白 (ethylene responsive factor binding protein, ERF) 属于AP2/ERF 转录因子超 家族中的 ERF 家族, 是植物所特有的一类转录因子, 在植物生长、发育以及应对各种环境刺激等方面均发挥重 要的作用。本文从丹参中克隆得到一个丹参SmERF 基因, 该基因属于拟南芥和水稻ERF 家族中的VII 组, 含有 CMVII-1 的蛋白模体, 序列为MCGGAI (I/L), 且在AP2/ERF 功能域的5 端含有一个内含子。通 对丹参主产区 山东、陕西、四川 181 个样本的检测, 发现 SmERF 第二外显子区域存在大量的变异位点, 264 bp 范围内共存 在21 个单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism, SNP), 有 14 个为非同义突变, 7 个为同义突变。不同产 地样品具有产地特异的基因型, 其中有5 个位点在不同产地间均表现出显著差异, 聚类分析表明SmERF 基因可 按产地聚类。该结果显示SmERF 基因有望作为丹参产地鉴别的标识基因, 并为SmERF 基因功能的确定奠定了 基础。 关键词: 丹参; 乙烯应答因子结合蛋白; 多态性分析 中图分类号: R931.5 文献标识码:A 文章编号: 0513-4870 (20 10) 09-1188-06 Cloning and polymorphism analysis of SmERF in Salvia miltiorrhiza * CUI Guang-hong, FENG Hua, LI Wen-yuan, WANG Wan-yi, HUANG Lu-qi (Institute of Chinese Materia M edica, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beij ing 100700, China) Abstract: The transcription factor of ethylene responsive factor binding protein (ERF) is belonged to AP2/ERF superfamily, which is known to be unique in plants. AP2/ERF proteins have important functions in the transcriptional regulation of a variety of biological processes related to growth and development, as well as various responses to environmental s