髓母细胞瘤基因表达谱芯片关键基因的生物信息学分析.PDF

22 卷 6 期 生命科学研究 灾燥造援22 晕燥援6 年 月 圆园18 12 蕴蚤枣藻 杂糟蚤藻灶糟藻 砸藻泽藻葬则糟澡 Dec. 圆园18 DOI ：10.16605/ki.1007-7847.2018.06.006 母细胞瘤基因表达谱芯片关键基因的 生物信息学分析 1, 2 3 4 1 1 1 1* 敏 董 强 唐圣桃 陶依然 吴 铮 王鲲宇 王 文 , , , , , , (1. 都医科大学宣武医院, 中国北京100053; 2. 河北北方学院, 中国河北 张家口075000; 3. 兰州大学第二医院, 中国甘肃 兰州730030; 4. 郴州市第一人民医院, 中国湖南 郴州 423000) 要 筛选髓母细胞瘤(medulloblastoma, MB)发生发展的关键基因, 可为MB 分子机制的进一步研究提供生 : 物信息学依据 本文通过下载GEO (Gene Expression Omnibus)数据库GSE50161 原始数据, 利用R 语言对正常 脑组织与髓母细胞瘤组织中差异表达的基因进行分析; 通过生物信息学分析工具(DAVID STRING 和Cytoscape) 尧 对差异基因进行生物学功能和蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析, 并通过PPI 筛选互作调控 的关键基因 结果显示, 总共筛选 999 个差异表达的基因, 鉴定了CCNB 1尧A URKB 尧MAD2L 1尧CENPE 尧KIF2C尧 1 1 80 20 十个关键基因 差异基因生物学功能主要富集于有丝分裂的核分裂 染 B UB 尧BUB B 尧NDC 尧CENPF尧CDC 尧 色体分离 微管蛋白结合 RAGE 受体结合等生物过程 KEGG 信号通路分析结果显示差异基因主要富集于细 尧 尧 胞周期 NF- B IL-17 和T 细胞受体等信号通路 10 个关键基因的生物学功能和信号通路主要富集于细胞有 尧 尧 丝分裂和细胞周期通路 因此, 细胞周期通路对MB 的增殖和分裂起着关键性的作用, 相关的分子机制值得进 一步深入研究 关键词 髓母细胞瘤(MB); 差异基因; 蛋白质互作网络; 生物信息学 : 中图分类号 R739.41 文献标识码 A 文章编号 1007 7847(2018)06 0468 07 : : : - - - Bioinformatics Analysis of Key G