基于位并行技术的带通配符约束的模式匹配问题研究-计算机软件与理论专业论文.docxVIP

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  • 2019-03-23 发布于上海
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基于位并行技术的带通配符约束的模式匹配问题研究-计算机软件与理论专业论文.docx

基于位并行技术的带通配符约束的模式匹配问题研究摘 基于位并行技术的带通配符约束的模式匹配问题研究 摘 要 模式串匹配是计算机科学中一个基本、重要的研究问题。随着信息技术的 高速发展,它在Internet网络信息搜索、数据流挖掘、网络入侵检测、计算生 物学等领域中的应用越来越广泛。 近年来,带通配符约束的模式匹配问题作为模式匹配领域的一项新颖的研 究方向已经越来越引起广泛的关注。在传统的模式中加入通配符约束,虽然使问题 变得更复杂,但更能满足用户对模式的灵活定义的需求。这使得带通配符约束的模式 匹配问题不仅具有理论研究价值,而且有着实际应用价值:如在生物信息学中,很多 蛋白质模式便含有通配符约束。当前对带通配符的模式匹配存在的很多现有的工作, 但仍然有一些问题需要进一步的研究,如在模式中通配符约束的定义,匹配结果 的表达,时间效率的提高。为此,本文针对以上关键问题进行研究,主要工作如下: (1)本文在已有的工作基础上,介绍同时包括全局长度约束及局部通配符约束 模式匹配问题的形式化定义,证明在One.Off条件下带通配符约束的模式匹配问题是 一个NP.hard问题。 (2)提出一种基于位并行技术的提出的BPBM算法。算法基于“最左最优”的 启发式策略,返回One—Off条件下的所有匹配序列。该算法的基本思想是采用了BM 算法的基于后缀搜索的方法,使用两个非确定性自动机NFA对扫描文本的

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