运用基于高通量测序和大数据挖掘的元基因组学方法分析中药制剂的.PDFVIP

用基于高通量测序和大数据挖掘的元基因组学方法分析中药制剂的物种成分 1 2* 1* 白虹 ，宁康 ，王长云 1. 中国海洋大学医药学院，海洋药物教育部重点实验室，山东 青岛266003 ；2. 中国科学院青岛生物能源与过程研究所，单细胞研究中心生物信息学团队，山东 省能源生物遗传资源重点实验室，中国科学院生物燃料重点实验室，山东 青岛 266101 摘要：中药制剂质量评价以化学成分分析为主，而物种成分分析近年来引起了中 医药界的极大关注，特别是对于丸剂类中药制剂的质量评价更为重要。建立中药 制剂物种成分的快速、准确、系统的分析方法，是实现中药现代化、产业化和国 际化的关键之一。中药制剂物种成分分析的实质是对包含多个生物物种的混合体 系 （混合生物样本）的物种鉴定。基于高通量测序和大数据挖掘技术的元基因组 学方法是目前认识、分析生物混合体系结构和功能最有效、最重要的方法之一。 利用元基因组学方法将有助于建立中药制剂的物种评价方法。通过选择合适的 DNA 分子标记，可对配伍处方药材物种进行鉴别，同时通过大规模数据分析和 挖掘鉴别制剂中的混伪品、有毒动植物或受保护动植物的成分，以及在生产过程 引入的生物杂质，从而为中药制剂的有效性、安全性和合法性提供评价依据。 关键词：中药；物种成分；元基因组学；高通量测序；大数据挖掘 中图分类 ：R931 文献标识：A 文章编 ：0503-4870(2014)00-0000-00 Biological ingredient analysis of traditional Chinese medicines utilizing metagenomic approach based on high-throughput-sequencing and big-data-mining 1 2 1 BAI Hong , NING Kang , WANG Chang-yun 1. Key Laboratory of Marine Drugs, the Ministry of Education of China, School of 收稿日期：20 14-09-05 ；修回日期：20 14-10-24 基金项目：国家科技部863 项目（20 12AA02A707，20 13AA093001 和20 14AA021502 ），国家自然科学基 金 3127 14 10 和）和中德科学中心项目（GZ878 ）。 * 通讯作者：Tel ：86-532，Email ：ningkang@ ；Tel ：86-532，Email ： changyun@ 。 1 Medicine and Pharmacy, Ocean University of China, Qingdao 266003, China; 2. Shandong Key Laboratory of Energy Genetics, CAS Key Laboratory of Biof uels and BioEnergy Genome Center, Compu tational Biology Group of Single Cell Center, Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology, Chinese A cademy of Sciences, Qingdao 266101, China Abstract The quality of traditional Chinese medicines (TCMs) has been mainly evaluated based on