成像质谱在微生物代谢产物研究中的应用-生物技术进展.PDFVIP

生物技术进展 ２０１４年　 第４卷　 第３期　 ２１１～２１５ 技术与方法 Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　 ＩＳＳＮ２０９５⁃２３４１ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ｍｅｔｈｏｄｓ 成像质谱在微生物代谢产物研究中的应用 徐玉泉 中国农业科学院生物技术研究所，北京 １０００８１ 摘　 要： 微生物代谢产物的结构和功能多样，对相邻微生物和环境会产生重要影响。 传统的天然产物分离方法不能系 统全面地监测单一或混合微生物样品中代谢物的合成和释放模式。 成像质谱能够同时可视化观察从单一微生物菌落到 复杂微生物群落的多个代谢产物的时空分布，可以用于发现重要的生物活性分子，观察微生物菌落的代谢交流，以及跟 踪微生物之间相互竞争过程中代谢物的修饰等方面的研究。 本文综述了成像质谱在微生物代谢产物研究中的最新进 展，展望了该技术的应用前景。 关键词： 成像质谱；代谢产物；代谢交换 ＤＯＩ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．２０９５⁃２３４１．２０１４．０３．１２ Ｔｈｅ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ｉｍａｇｉｎｇ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ ｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ　 ＸＵ Ｙｕ⁃ｑｕａｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８１，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ ｗｉｔｈ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｈａｖｅ ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｉｍｐａｃｔ ｏｎ ｔｈｅ ｎｅｉｇｈｂｏｒｉｎｇ ｍｉｃｒｏ⁃ ｏｒｇａｎｉｓｍｓ ａｎｄ ｔｈｅ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ． Ｔｈｅ ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌ ｍｅｔｈｏｄ ｏｆ ｎａｔｕｒａｌ ｐｒｏｄｕｃｔｓ ｉｓｏｌａｔｉｏｎ ｃａｎｎｏｔ ｍｏｎｉｔｏｒ， ｉｎ ａ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃ ａｎｄ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｖｅ ｆａｓｈｉｏｎ， ｔｈｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｒｅｌｅａｓｅ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｂｙ ｍｉｃｒｏｂｅｓ ｇｒｏｗｎ ｉｎ ａ ｐｕｒｅ ｏｒ ｍｉｘｅｄ ｃｕｌｔｕｒｅ． ＭＡＬＤＩ⁃ｉｍａｇｉｎｇ ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ ｃａｎ ｖｉｓｕａｌｉｚｅ ｂｏｔｈ ｓｐａｔｉａｌ ａｎｄ ｔｅｍｐｏｒａｌ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓｆｒｏｍ ａ ｓｉｎｇｌｅ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｃｏｌｏｎｙ ｔｏ ｃｏｍｐｌｅｘ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ． Ｉｔ ｃａｎｂｅａｄａｐｔｅｄｔｏｄｉｓｃｏｖｅｒｎｏｖｅｌｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｌｙ ａｃｔｉｖｅｍｏｌｅｃｕｌｅｓ，ｏｂｓｅｒｖｅｍｅｔａｂｏｌｉｃｅｘｃｈａｎｇｅｏｆ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｃｏｌｏｎｉｅｓ，ａｎｄ ｔｒａｃｋ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅ ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ ｄｕｒｉｎｇ ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｅｓ ｃｏｍｐｅｔｉｔｉｏｎ． Ｔｈｉｓ ｐａｐｅｒ ｒｅｖｉｅｗｓ ｏｎ ｒｅｃｅｎｔ ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｏｆ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｂｙ ｉｍａｇｉｎｇ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，ｐｒｏｓｐｅｃｔｓ ｔｈｅｆｕｔｕｒｅ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｉｓ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ． Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：ＭＡＬＤＩ⁃ｉｍａｇｉｎｇ ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ；ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ；ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｅｘｃｈａｎｇｅ 　 　 微生物合成的代谢产物结构和功能多样，广 代谢产物的结构和生物活性。 该方法和微生物产 泛应用于医药和农业生产领域。 另一方面，这些 生这些代谢物的环境割裂开来，无法系统化多角 代谢产物对于微生物自身的生长、发育以及对环 度地了解微生物在菌落水平上产生这些代谢