一对双胞胎脑瘫患儿全基因组测序分析-郑州大学学报医学版.PDFVIP

·７９６· 郑州大学学报（医学版）　２０１８年 １１月　第５３卷　第６期 ｄｏｉ：１０．１３７０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７１６８２５．２０１８．０７．０１７ 一对双胞胎脑瘫患儿全基因组测序分析 朱庆文，周　翔，倪玉飞，王　婧，印洪刚，张　勤，卞文君，张玲莉，林孟思，刘江悦，周　君，沙春秀 南通市妇幼保健院（南通大学附属妇幼保健院）产前诊断中心 江苏南通 ２２６００６ 关键词　脑瘫；双胞胎；全基因组测序；生物信息学分析 中图分类号　Ｒ７４２．３ 摘要　目的：利用全基因组测序（ＷＧＳ）技术分析一对双胞胎脑瘫患儿的遗传学病因。方法：采用 ＷＧＳ技术对 一对双胞胎脑瘫患儿进行检测，同时对其父母进行了基因芯片的验证试验。结果：共发现 ３０个与脑瘫有关联的基 因，其中相关热点的基因有人类转录激活因子蛋白４、ＧＡＤ１、ＡＤＤ３等；在 ＫＡＮＫ１外显子区域发现一个共有的ＳＮＰ 突变；在２号染色体上发现有大约 １２０ｋｂ的重复，１４号染色体上有大约２８０ｋｂ和５４０ｋｂ的缺失；１４号染色体片段 异常来自母亲。结论：脑瘫遗传因素复杂，可能由多个基因诱发；ＷＧＳ技术适用于脑瘫的遗传学研究。 Ｗｈｏｌｅｇｅｎｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇａｎａｌｙｓｉｓｏｆａｐａｉｒｏｆｔｗｉｎｓｗｉｔｈｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙ ＺＨＵＱｉｎｇｗｅｎ，ＺＨＯＵＸｉａｎｇ，ＮＩＹｕｆｅｉ，ＷＡＮＧＪｉｎｇ，ＹＩＮＨｏｎｇｇａｎｇ，ＺＨＡＮＧＱｉｎ，ＢＩＡＮＷｅｎｊｕｎ，ＺＨＡＮＧ Ｌｉｎｇｌｉ，ＬＩＮＭｅｎｇｓｉ，ＬＩＵＪｉａｎｇｙｕｅ，ＺＨＯＵＪｕｎ，ＳＨＡＣｈｕｎｘｉｕ ＰｒｅｎａｔａｌＤｉａｇｎｏｓｉｓＣｅｎｔｅｒ，ＮａｎｔｏｎｇＭａｔｅｒｎａｌａｎｄＣｈｉｌｄＨｅａｌｔｈＣａｒｅＨｏｓｐｉｔａｌ（ＭａｔｅｒｎａｌａｎｄＣｈｉｌｄＨｅａｌｔｈ ＣａｒｅＨｈｏｓｐｉｔａｌｏｆＮａｎｔｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ），Ｎａｎｔｏｎｇ，Ｊｉａｎｇｓｕ２２６００６ Ｋｅｙｗｏｒｄｓ　ｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙ；ｔｗｉｎｓ；ｗｈｏｌｅｇｅｎｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ；ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓ Ａｂｓｔｒａｃｔ　Ａｉｍ：Ｔｏａｎａｌｙｚｅａｐａｉｒｏｆｔｗｉｎｓｗｉｔｈｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙｂｙｗｈｏｌｅｇｅｎｏｍｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ（ＷＧＳ）ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ．Ｍｅｔｈ ｏｄｓ：ＡｐａｉｒｏｆｔｗｉｎｓｗｉｔｈｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙｗｅｒｅｓｕｂｊｅｃｔｅｄｔｏＷＧＳ．Ｔｈｅｐａｒｅｎｔｓｗｅｒｅｔｅｓｔｅｄｏｎａｍｉｃｒｏａｒｒａｙ．Ｒｅｓｕｌｔｓ：Ａｔｏｔａｌ ｏｆ３０ｇｅｎｅｓａｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙｗｅｒｅｆｏｕｎｄ．Ｔｈｅｒｅｌａｔｅｄｈｏｔｇｅｎｅｓｉｎｃｌｕｄｅｄｈｕｍａｎｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｃｔｉｖａｔｏｒｐｒｏｔｅｉｎ ４，ＧＡＤ１，ＡＤＤ３，ｅｔｃ，ａｎｄａｃｏｍｍｏｎＳＮＰｍｕｔａｔｉｏｎｗａｓｆｏｕｎｄｉｎｔｈｅｅｘｏｎｒｅｇｉｏｎｏｆＫＡＮＫ１．Ｔｈｅｄｕｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆ１２０ｋｂｏｎ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ２ａｎｄｄｅｌｅｔｉｏｎｏｆ２８０ｋｂａｎｄ５４０ｋｂｏｎｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ１４ｗａｓｆｏｕｎｄ，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ａｂｎｏｒｍａｌｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ１４ ｃｏｍｅｓｆｒｏｍｍｏｔｈｅｒ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ：Ｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｆａｃｔｏｒｓｏｆｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙｉｓｃｏｍｐｌｅｘ，ａｎｄｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙｍａｙｂｅｉｎｄｕｃｅｄｂｙ ｍｕｌｔｉｐｌｅｇｅｎｅｓ．ＷＧＳｉｓａｎａｐｐｒｏｐｒｉａｔｅｔｅｃｈｎｉｑｕｅｆｏｒｔｈｅｓｔｕｄｙｏｆｃｅｒｅｂｒａｌｐａｌｓｙ． ［１］ 　　脑瘫是目前导致我国儿童致残的首位原因 。 参考了人类参考基因组 （ｖｅｒｓｉｏｎ：ＮＣＢＩＢｕｉｌｄ３７／ 临床上诱发脑瘫的因素很多。由于脑瘫患儿拥有近 ｈｇ１９）。现将研究结果报道如下。 似的症状，故遗传因素成为脑瘫病因探索的重要方 ［２３］ １　资料与方法 向。已有大量文献 报道了拷贝数变异 （ｃｏｐｙ ｎｕｍｂｅｒｖａｒｉａｔｉｏｎ