2基因组学概论教材编辑.ppt

第1章 基因组学概论;;;DNA;一、基因组学概况 二、基因组学的历史沿革 三、基因组学的发展历程 四、后基因组学产生的背景 五、后基因组学的主要研究内容;基因组学;一、基因组学概况;（一）基因组学基本概念;1. 基因(Gene);基因的结构;2. 基因组（genome）“Gene” + “ome” ;真核生物基因组：;3. 基因组学（genomics）;简言之，基因组学就是在基因组水平上研究基 因组结构和功能的科学，其内容包括基因的结 构、组成、存在方式、表达调控模式、基因的 功能和相互作用等，是研究与解读生物基因组 所蕴藏的所有遗传信息的一门新的前沿学科。;4、与基因组学相关的几个概念 转录组学（transcriptomics） 蛋白质组学（proteomics） 表型组学（phenomics） 遗传学：基因型 + 环境 = 表型;各式各样的“组”与“组学”;（二）基因组学分类;结构基因组学——着重遗传图、物理图、测序等研究； 比较基因组学——包括对不同进化阶段生物基因组的比较研究，也包括不同物种、族群和群体基因组的比较研究。 功能基因组学——包括以转录图为基础的功能制图（基因组表达图）；;（三）基因组学的意义;(1)单基因病疾病基因研究,如血友病等;（2）多基因病疾病基因研究， 例如心脏病，糖尿病，癌症等。 ;（3）癌症基因组解剖学计划;二、基因组学发展的历史沿革;（一）1900年代以前:前遗传学时代 ;（2）1865年G.Mendel发表豌豆杂交实验结果，提出了遗传学的两大遗传规律—分离规律和独立分配规律，并认为是生物体内的遗传因子控制生物性状。 ;（二）1900—1950年代:经典遗传学时代 ;1839年 细胞学说的提出；;肺炎双球菌的转化实验;光滑型的菌株产生荚膜，有毒，在人体内它导致肺炎，在小鼠体中它导致败血症，并使小鼠患病死亡，其菌落是光滑的； 粗糙型的菌株不产生荚膜，无毒，在人或动物体内不会导致病害，其菌落是粗糙的。 结论：RNA、蛋白质和荚膜多糖均不引起转化，而DNA却能引起转化。如果用DNA酶处理DNA后，则转化作用丧失。 加热温度是60度 实质是S型的DNA或基因与R型活细菌DNA之间重组,使后者获得了新的遗传信息。 外源DNA分子一旦找到它的内源同源体，这两个分子就可进行遗传交换了。交换的结果是使外源DNA被整合，而使同源的内源DNA分子从R型细菌的DNA中排斥出去，从而产生由R型细菌变为S型细菌的遗传转化。 ;遗 传 物 质 是;;总之，自从人们认识到“基因决定生物性;（三）1950—1990年代:分子生物学时代 （前基因组学时代）; 1953年，J.Watson，F.Crick根据DNA的X射线衍射图谱，提出了DNA双螺旋结构模型，解释基因复制的机制，从而真正开始从分子水平上研究生命活动。 生物学研究也从此进入了分子生物学时代。;James Dewey Watson （1928～）; 1953—1970年：分子生物学的迅猛发展: ① mRNA、DNA聚合酶、RNA聚合酶的发现； ②DNA半保留复制机理、操纵子学说等的提出； ③遗传密码的发现，其通用性的证明； ④64个密码子破译； ⑤中心法则：“DNA→RNA→蛋白质”的建立,标志着 分子生物学学科理论体系形成； ⑥重组DNA技术的建立，使得分子生物学的技术体系初 步形成，或者说，生命科学进入了前基因组学时代。;1.逆转录酶的发现，修正和完善了中心法则;20世纪80年代，人们从疯牛病等疾病中发现其感染 因子是一种与正常细胞膜蛋白（PrPC）一级结构完 全相同，但高级结构、理化特性不同的PrPSc或 prion蛋白（阮蛋白？）。;？;3.工具酶的发现、重组DNA技术的建立 4.“断裂基因”的发现 5.DNA测序方法建立，读取遗传信息成为可能； 6.PCR技术建立， 7.基因表达与调控研究的不断拓宽和深入； 8.转基因技术的建立与转基因动植物的成功； 9.人类疾病的基因诊断和基因治疗 ;（四）1990—2000年代：基因组学时代 ;;人类基因组计划;1.人类基因组计划;1985年5月，美国能源部提出“人类基因组计划草案； 1986年3月7日，Dulbecco R在Science上发表了 一篇有关开展人类基因组计划的短文,推动了全世界的人类基因组计划的发展； 1990年10月1日美国国会正式批准的“人类基因组计 划”。计划在15年内投入30亿美元以上的资金进行人类基因组的分析，即对人类3×109个核苷酸进行测序。;（1）HGP(human genome project,HGP)的内容：;（2）HGP的任务;遗传图(genetic map)：又称连锁图(linkagemap), 是以具有遗传多态性的遗传标记作为“位标”，遗传