第三章-医学遗传学-人类基因组.pptVIP

在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。 在人类基因组中鉴别出占具2%－5%长度的全部基因的位置、结构与功能，最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。 基 因 图 基 因 图 CpG岛的应用 CpG岛(CpG island)：描述哺乳动物基因组DNA中的一部分序列，其特点是C和G的总和超过4种碱基总和的50%，即每10个核苷酸约出现一次双核苷酸序列CG。具有这种特点的序列仅占基因组DNA总量的10%左右。 从已知的DNA序列统计发现，几乎所有的管家基因(House-Keeping gene)及约占40%的组织特异性基因的5‘末端含有CpG岛，其序列可能包括基因转录的启动子及第一个外显子。因此，在大规模DNA测序计划中，每发现一个CpG岛，则预示可能在此存在基因。 基 因 图 计算机应用及cDNA策略 计算机应用：通过软件进行预测（生物信息学） cDNA策略：把特定组织中的mRNA分离出来，经反转录合成cDNA片段，建立EST位标，根据转录顺序的位置和距离绘制的图谱。 是染色体DNA某一区域内所有可转录序列的分布图，是基因图的雏形。 第三节 后基因组时代 ( Postgenome era) * 人类基因组计划完成之后，生物学被重新划分为前基因组和后基因组两部分。 * 科学研究已开始进入“后基因组时代”。主要是开展蛋白质组的研究。 * 有科学家形象地说道：即使基因测序全部完成，也只好像是一本没有姓名、只有号码的电话簿。“后基因组时代”的最终目标，是要把深奥的DNA语言变成一本基因大百科全书。 人类基因组工程(human genome projects)的含义 尽管工程规模和要处理的信息量都很大，但其技术难度似乎不好与阿波罗计划和迈哈顿计划相比。 是人类了解生命现象过程中的重要一步，但它所能够回答的问题是有限的！ 它不会立刻使我们的寿命延长。 不会使我们立刻知道人类疾病的发病机理和治疗方法。 不会告诉我们思维过程和个体发育的机制。 不会告诉我们地球上的生命究竟是怎样产生的。 人类基因组序列测完后（“后基因组时代”）的工作 分析所有的这些基因及其编码产物（主要是蛋白质）是如何单独和共同在生命过程中发挥作用的 。 在目前阶段研究蛋白比研究基因难得多，而成千上万的结构和功能都复杂多样的蛋白分子才是生命过程的最后执行者。 我们现在还没有有效的研究手段去揭示蛋白分子在生物体内究竟完成什么功能、又是通过何种机制去完成其生物功能的等等。 一、基因组多样性计划 不同人种、不同民族基因组的异同关系。 探讨人类进化和种族演化的历史。 个体化用药。 疾病易感性。 二、功能基因组学 完成一个生物体全部基因组测序后即进入后基因组测序阶段——详尽分析序列，描述基因组所有基因的功能，包括研究基因的表达及其调控模式，这就是功能基因组学（functional genomics）。 （一）鉴定DNA序列中的基因 （二）同源搜索设计基因功能 （三）实验性设计基因功能 （四）描述基因表达模式 功能基因组学的主要具体内容包括以下方面 功能基因组学研究策略及主要内容 三、比较基因组学 比较基因组学(comparative genomics)涉及比较不同物种的整个基因组，是利用生物在进化上的亲缘关系，来比较它们与人类之间的相似与相异，以便深入理解每个基因组的功能和进化关系。 四、环境基因组学与环境因素相关的疾病遗传易感性基因 五、疾病基因组学 分离、分析疾病的致病基因和相关基因，并研究其致病机制 六、药物基因组学 研究包括药物在内的化学物质引起机体反应上的遗传差异 以生物大分子为研究对象，以计算机为工具，运用数学和信息科学的观点、理论和方法去研究生命现象、组织和分析呈指数级增长的生物信息数据的一门科学. 七、生物信息学 http://www.ebi.ac.uk/embl/ http://www.ddbj.nig.ac.jp/。 第四节 基因定位与克隆 人类基因组计划的完成，最重要的后续工作是运用一定的方法，将各个基因确定到染色体的实际位置。 基因定位对提高人类对疾病产生的病因学的认识有重要意义。 1.连锁分析（Linkage analysis） 基因定位的连锁分析是根据基因在染色体上呈直线排列，不同基因相互连锁成连锁群的原理，即应用被定位的基因与同一染色体上另一基因或遗传标记相连锁的特点进行定位。 基因定位的方法 重组值（recombination fraction） 是基因定位时两个基因间遗传图距的量度，即基因间的遗传距离。如果两个基因间有1%的重组值，其遗传图的距离为1厘摩。（