基于微卫星标记的青岛绿潮浒苔种群的遗传多样性-细胞生物学专业论文.docxVIP

暨南大学硕士学位论文 暨南大学硕士学位论文 万方数据 万方数据 摘要 2007 年~2013 年，我国青岛海域连续七年暴发大规模绿潮。特别是在 2008 年的夏天，青岛暴发了世界上最大规模的绿潮，引起了严重的社会问题和海洋生 态问题。绿潮的物种组成、种群遗传结构和遗传多样性的研究对查明绿潮暴发的 原因，寻找合适的预防措施具有重要意义。 为掌握青岛绿潮的物种组成，了解绿潮种群的遗传结构和遗传多样性，本文 于 2013 年 6 月 19 日在青岛绿潮现场的 21 个站点收集了 210 个漂浮绿藻样品， 利用 nrDNA ITS、rbcL 和 5S 基因序列对采集到的样品进行了分子鉴定，进一步 利用自行开发的微卫星（simple sequence repeat, SSR）引物，对浒苔（Ulva prolifera）的种群遗传结构和遗传多样性进行了分析。 nrDNA ITS 和 rbcL 序列分析结果显 示 ， 210 个绿藻样品全 部 为 Ulva linza-procera-prolifera（LPP）复合体。5S 序列的分析进一步证实，这些绿潮样 品均为浒苔，表明青岛绿潮，至少 2013 年的绿潮，是由单一物种浒苔形成的。 基于浒苔 EST 序列和 ISSR 引物，开发出 8 对浒苔微卫星引物。SSR 标记共 检测到 17 个等位基因。SSR 位点的观察等位基因数为 1~3 个，平均观察等位基 因数为 2.125 个，有效等位基因为 1.000~1.235，平均有效等位基因是 1.160。Nei‘s 基因多样性(H)为 0.000～0.189，平均值为 0.064；香农指数（I）为 0.00~0.367， 平均为 0.133，这些结果提示青岛绿潮浒苔种群的遗传多样性较低。考虑到浒苔 可行有性生殖、无性生殖和单性生殖等三种生殖方式，其中以无性生殖为最主要 的方式，我们推测浒苔的生殖方式和对环境的高度适应性，可能是其形成单一物 种绿潮的原因；其较低的遗传多样性除了与生殖方式有关外，还可能与本文所用 的微卫星标记引物的来源有关。研究结果可为阐明青岛绿潮的形成与暴发机制、 明确绿潮的来源提供参考和依据。 关键词：浒苔；遗传多样性；ITS；rbcL；5S；微卫星 I Abstract The large-scale green tides have occurred in Qingdao coast in China for seven consecutive years from 2007 to 2013. Especially in the summer of 2008, the world‘s largest green tide bloom occurred in the coast of Qingdao, which caused serious social problems as well as marine ecological issues. It is essential to study the species composition, genetic structure and genetic diversity of these green tides for understanding the green blooms and finding possible solutions to the problems. To provide more information on the species composition of these green tides and explore the genetic structure of Ulva prolifera bloom in 2013, 210 free-floating samples isolated from green algae bloom in Qingdao coast in June 19, 2013 were identified based on the ITS, rbcL and 5S sequence. Additionally, some microsatellite primers were developed from ISSR primers and in terms of the expressed sequenced tags (EST) from GenBank, and the genetic diversity was investigated using them. According to the ITS sequence and rbcL gene, 210 samples from green