基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记.pdfVIP

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2019-03-27 发布于广西
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基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记.pdf

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(Jiangsu J． of Agr． Sci． ) 江苏农业学报，2014 ，30 (5):997 ～ 1002 h ttp :/ /www． jsn y x b． com 997 ，，，．ＲNA-Seq EST-SSＲ［J］．，2014 ，30 (5) 戚维聪程计华黄邦全等基于海甘蓝序列开发分子标记江苏农业学报 :997-1002． doi :10． 3969 /j． issn． 1000-4440． 2014． 05． 012 基于海甘蓝ＲNA- Seq 序列开发EST-SSＲ分子标记 1，2 2 ，3 4 1 1 维聪，计华，邦全，，戚程黄李坦林峰 (1．， 210014 ;2．， 6708PB ; 江苏省农业科学院农业生物技术研究所江苏南京荷兰瓦赫宁根大学植物育种系荷兰瓦赫宁根 3．， 430074 ;4．， 430062 ) 中国科学院武汉植物园湖北武汉湖北大学生命科学院湖北武汉 : ( ) ＲNA-Seq 186 778 cDNA 摘要利用油料作物海甘蓝十字花科发育时期种子的测序数据组装获得条重叠 (Contigs) ， MISA Primer 3 6 639 EST-SSＲ。，群序列通过和程序设计了个分子标记在这些标记中除了单核苷酸重 (45% ) ， SSＲ (29% )， (10% )、复外三核苷酸重复的是最常见的碱基重复类型其次是双核苷酸型五核苷酸型 (7% )、 (5% ) (2% ) 。 1 206 EST-SSＲ六核苷酸型和四核苷酸型型采用电子定位的方法将个标记定位到近缘种白 (Brassica napa) 。， 20 EST-SSＲ