生物信息技术发展态势分析-北京玛格泰克科技发展有限公司.PDFVIP

中　国　生 　物 　工 　程 　杂 　志 第 23 卷第 5 期 CHINA BIOTECHNOLOGY 2003 年 5 月 生物信息技术发展态势分析 赵爱民 (科学技术部中国生物工程开发中心　北京 　100081) 摘要 　随着计算机科学和互联网技术的进步 ,生物信息学得到了长足的发展 。综述了国际生物 信息技术的发展态势 ,分析了生物信息技术研发和应用的热点和重点 ,并且在概述国内生物信息 发展状况的基础上 ,提出发展我国生物信息技术的建议 。 关键词 　生物信息 　基因组 　蛋白质组 　　2 1 世纪是生命科学的时代 , 也是信息时代 。 生物信息学为基础的新生物学的整合[2 ] ”。这里相 随着人类基因组计划的各项任务接近完成 ,有关核 应基础设施则包括 :新的数据库体系 、高性能计算 ( ) 酸 、蛋白质的序列和结构数据呈指数增长 。面对巨 能力和网格 Grid 技术 ,生物学数据分析和模拟技 大而复杂的数据 ,运用计算机管理数据 、控制误差 、 术体系 ,生物过程的信息可视化技术体系等 。 加速分析过程势在必行 , 从而使生物信息学成为 长时间以来 ,生物信息学一直被认为是一个建 当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一 ,也 立在对 DNA 和蛋白质序列比较基础上的学科 , 目 是 2 1 世纪自然科学的核心领域之一 。 的是发现进化关联 ,并由此进行功能比较 。但在 目 近年来 ,计算机和互联网的发展更是为生物信 前 ,人们更为关注的是基于体系或系统的方法 , 即 息的传递提供了硬件基础和便利 ,大大地推动了生 系统生物信息学方法 ,分析蛋白质分子或代谢途径 物信息学的发展 。目前 ,虽然其研究重点主要体现 间的相互作用 ,发现体系或系统赖以运转的最小构 ( ) ( 在基因组学 Genomics 、比较基因组学 Comparative 成单元集合 。也就是说 ,发现那些交换共同的酶底 ) ( ) genomics 和蛋白组学 Proteomics 等方面 ,具体说就 物或形成大的超分子复合物的分子 。从最近两年 是在基因组和蛋白质组水平上 ,从核酸和蛋白质序 来的生物信息学研究论文发表情况统计 ,可 以看 列 、表达谱数据出发 ,分析序列中表达的结构与功 出 ,在后基因组时代 ,生物信息学的主要研究内容 能、基因调控网络 、生化代谢途径的生物信息 , 随 已经从对 DNA 和蛋白质序列进行比较 、编码区分 后 ,基于生物信息学的系统生物学的研究也开始成 析 ,分子进化转移到大规模的数据整合 、可视化 ,转 为生命科学研究的新的热点[ 1] 。 移到比较基因组学 ,代谢网络分析 ,基因表达谱网 当前 ,生物信息技术的重要性越来越突出。美 络分析 ,蛋白质组技术数据分析处理 ,蛋白质结构 国能源部在 2001 年 4 月紧接着人类基因组计划提 与功能分析以及药物靶点筛选等 ,分别与功能基因 出的旨在了解生命的奥秘的新的“从基因组到生 组 、蛋白质组 、结构基因组等研究领域互相配合 、紧 命”的 10 年宏伟规划的前言中郑重指出“2 1 世纪的 密相关 ,成为 目前极其热门的系统生物学研究的重 生物学最重要的任务是在基因组水平上认识生命 要的基石[ 1] 。