核酸结浩合蛋白课件.ppt

第17章核酸结合蛋白 基本概念和定义 蛋白和核酸的相互作用主要可分为四类： （1）即结构和包装作用（如组蛋白、病毒衣壳蛋 白等）； （2）运输和定位作用（tRNA,mRNA和核糖体结合）； （3）代谢和重排作用（如DNA和RNA聚合酶、核酸 酶、解旋酶等）； （4）基因表达作用（如RNA聚合酶、转录因子、核 糖体和起始因子等）。 值得注意的是：对于特定蛋白而言，其功能并 不是唯一的。 根据底物的特殊性，核酸结合蛋白可分为三类： （1）非特异性结合蛋白； （2）序列特异性结合蛋白； （3）结合特殊结构的蛋白（如在DNA中的不正常碱基，重组中间体，以及核内含子套索）。 大部分核酸结合蛋白在一个内部位点以定位方式相互作用。 用于蛋白和核酸识别的非共价键主要包括（1）静电吸引和氢键，（2）主链连接，（3）氢键和碱基连接。同时，在相互作用时，蛋白和核酸的构象常常发生改变，以产生最大的互补作用表面。 (二)RNA识别的一般方式 1、识别基础： （1）一级序列（如SD序列，加尾序列） （2）RNA折叠形成的高级结构： 二级结构(突起，发夹，茎环)如著录 终止，tRNA的加工，内含子剪切等 三级结构（三股螺旋，tRNA的L-形结构） 如aa-tRNA和氨酰合成酶的结合 。 2、RNA结合蛋