木脂素类化合物中组蛋白去乙酰化酶抑制剂的虚拟筛选.pdf

木脂素类化合物中组蛋白去乙酰化酶抑制剂的虚拟筛选 ＊ # 邸 珂 ，喻欢欢，邹远军，丁 锐，钟 猛，胥秀英，郑一敏 （重庆理工大学药学与生物工程学院，重庆 400054） 中图分类号 R965.1 文献标志码 A 文章编号 1001-0408（2016）04-0494-04 DOI 10.6039/j.issn. 1001-0408.2016.04.20 摘 要 目的：虚拟筛选具有组蛋白去乙酰化酶（HDAC ）抑制作用的木脂素类化合物。方法：以“木酯素”“Lignanoid”为关键词， 查询中国知网、维普、PubMed 等中外文数据库中相关文献，收集木脂素类化合物作为配体构建配体库，从蛋白质晶体数据库 （PDB ）中选取两个HDAC 受体HDAC2（PDB code ：4LXZ ）和HDAC8（PDB code ：1T69），运用SYBYL-X 2.0软件将配体和受体三 维结构的活性位点进行对接，用总得分来反映配体与受体的亲和力大小。结果：将收集的345个木质素类化合物与4LXZ 、1T69原 配体一起构建了有347种配体的配体库，其中编号为275、271、