主成分分析在动物科学的应用研究进展.docVIP

主成分分析在动物科学的应用研究进展 宋志芳解佑志芦春莲李赛曹洪战 河北农业大学动物科技学院河北正农牧业有限公司 摘要： 主成分分析（PCA）釆取降维思想，同时保持数据对方差贡献最大的特征，在畜 牧生产上用于研宄影响性状的变量，既简化变量个数，又获取足量信息，降低 课题研究的复杂性。在全基因组关联分析（GWAS）屮，PCA可用于校正群体分层, 降低群体分层对关联结果的假阳性，通过PCA图可以看出研宂群体是否有分层 现象。本文主耍对PCA的原理、分析软件以及在畜牧生产和GWAS中的应用加以 综述。 关键词： 主成分分析;群体分层;降维;假阳性;GWAS; 作者简介：宋志芳（1992-），女，山东菏泽人，硕士研宂生，研宂方向为动物 遗传育种，E-mail: 187302855760163. com 作者简介：曹洪战（1970-）,男，博士，教授，硕士、博士研究生导师，研究 方向为养猪土产与动物遗传育种与繁殖，E-mail :chz516@126. com 收稿日期：2017-05-22 基金：河北省科技计划项目） Research Progress on Principal Component Analysis in Animal Science SONG Zhi-fang XIE You-zhi LU Chun-lian LI Sai CAO Hong-zhan C