图位克隆及其序列分析水-国家水稻数据中心.PDFVIP

维普资讯 中 自 柳 茔 (C 辑) 第 33卷 第 6期 SCIENCEINCHINAfSetiesC) 2003年 12月 水稻稻米糊化温度控制基 因ALK的 图位克隆及其序列分析水 高振 宇①② 曾大力① 崔 霞② 周奕华② 颜美仙① 黄大年① 李家洋② 钱 前① (① 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室，杭州 310006；②国家植物基因研究中心， 中国科学院遗传与发育生物学研究所，北京 100101) 摘要 糊化温度是仅次于直链淀粉含量的评价水稻稻米蒸煮品质的重要指标．许多 文献报道，糊化温度受一主效基因控制．采用 图位克隆法分离克隆了水稻糊化温度基 因(AL ，序列分析表 明其编码可溶性淀粉合酶 Ⅱ．进 一步比较不 同品种 问该基因DNA 序列与碱消法分析结果，推测出ALK 基因编码 区内的碱基替换可能引起 了支链淀粉晶 体层结构的改变，从而导致糊化温度 的变化． 关键 词 水稻ALK基因 可溶性淀粉合酶 Il 糊化温度 图位克隆法 水稻是我 国第一大粮食作物，消费人 口占全世界人 口的 50％以上 ．随着稻米产量 的增长 和人们生活水平 的提高 ，对稻米品质 的追求 已 日益受到重视．糊化温度 (GT)是评价水稻稻米 蒸煮品质的重要指标，它是指淀粉粒在热水 中开始吸水并发生不可逆膨胀 、丧失其双折射性 (淀粉表面开始丧失特有 的极化相交转变为溶解状态)时的临界温度…．不 同水稻 品种米粒 的 GT一般分为高 (74oC)、中(70oC～74oC)、低 (70oC)三档 】．由于直接测定 GT较为 困难，因 此通常用碱消法来 间接评价 】．GT与蒸煮米饭所需的水分和时间相关，高 GT稻米较低 GT稻 米需要更多的水分和更长的蒸煮时间．针对用米的 目的，制作米粉罐头或耐贮糕点往往需多 次或较长时间蒸煮，且要求压 出的米条易于扩散 、不结块，故所用稻米应具有高 GT，以免制 品 在加工过程中过度糊化粘结，但饭用米一般要求 中、低 GT、 有关 GT的遗传，国内外学者做了较多的研究I4】，目前普遍认为 GT由一个主效基 因和若 干微效基 因共同控制．DH群体 的QTL分析显示，主效基 因位于水稻第 6号染色体短臂 的 Wx 基 因附近Io】．1994年 Lin等人 用 F2群体找到了距 ALK分别为 1．1和 3．0cM 的标记 C1478和 R2l47．最近 日本国立农业 中心研究又发现，决定籼粳稻间支链淀粉链长分布差异 的基 因 acl(t) 与 alk(t)和可溶性淀粉合酶 1Ia编码基 因(SSSlla)处在染色体的同一位点上18]． 水稻高密度遗传 图谱 、物理 图谱 的构建和水稻全基因组测序为 图位克隆法提供 了便 利 ，用该法 已先后成功克隆了水稻 的 白叶枯病抗性基 因Xa21和Xal，稻瘟病抗性基因Pi．b， 控制水稻高度 的基 因D，与 一 以及控制分蘖基 因MOC1和脆性控制基 因BC1l 引．本研究 2003．05．23收稿 2003一l0一l3收修改稿 国家转基 因专项 (批准号：JY03．A．07．01)和浙江省科技厅 、浙江省 自然科学基金资助项 目 联 系人，E—mail：qianqian188@hotmail．com 1 维普资讯 482 中 国 科 学 (C 辑) 第 33卷 采用 图位克隆法，利用 F群体成功地将基因 ALK定位并克隆，序列分析发现，该基因编码水 稻 SSSⅡ．经过对不 同水稻品种间这一基 因序列 的比对，结合碱消法分析结果 ，推测这些 品种 间 GT的差异是 由于碱基 的替换造成个别氨基酸 的改变而 引起 的．