不同海拔下花叶海棠叶片转录组核苷酸变异分析和比较Analysisand.PDFVIP

基因组学与应用生物学，2017年，第36卷，第10期，第4351-4356页 GenomicsandAppliedBiology,2017,Vol.36,No.10,4351-4356 研究报告 ResearchReport 不同海拔下花叶海棠叶片转录组核苷酸变异分析和比较 1,2* 3 4 1 5 6 1 张得芳 夏涛 文怀秀 王占林 刘霞 张磊 白灵娜 1青海大学农林科学院,西宁,810016青海大学三江源生态与高原农牧业国家重点实;2 验室,西宁,810016青海康普生物科技股份有限公司;3 , 西宁,810003中国科学院西北高原生物研究所;4 ,中国科学院藏药研究重点实验室,西宁,810008青海省干旱浅山造林试验站;5 ,西宁,810099; 6青海省玛可河林业局,班玛,814300 *通讯作者,defangstart2011@163.com 摘 要 利用IlluminaHiseq4000平台，对花叶海棠不同海拔下的样品进行了转录组测序，对其SNPs的数 目和分布特征进行了分析和比较。测序后共得到316759896条序列，共有47513984400的碱基量。序列组 装后得到 109578个平均读长为594.83的unigenes，共碱基，同时有 134