家蚕几种组织的EST及基因表达特征分析-特种经济动物饲养专业论文.docx

捅璺中文摘要 捅璺 中文摘要 本实验室选择家蚕12种不同组织器官和细胞。构建5’端非偏性cDNA文库，对每个文库火 规模EST测序。本文在获得的大规模EST数据基础上进行数据分析、挖掘，以期发现家蚕的重要功 能相关基因，并获取基因表达的组织差异和特异信息。这些基因的功能和表达信息获得-对家蚕有 用基因资源的深度开发及鳞翅目害虫的有效控制有重要价值。 1基于EST数据的基因表达谱聚类方法 本文采用基于大规模EST数据的基因表达谱聚类法。探讨在测序数据大量获得时从中提取有 价值信息的数据分析方法。利用两两基因(comig)或样本(文库)的相关系数定义基因或样本问 的距离，构建中高丰度表达基因和所有测序文库的进化树。从comig的进化树中获得具有一致表达 特征的成组基因。文库进化树反映了构建文库的组织阔的亲疏关系。 利用Audie和Cleaverie 取得的一个新的适用于分析标签抽样数据显著性检验的成对状况比 较法分析组织间差异表达基因，获得在两种组织间和同一组织不同时期基因表达显著不同的基因。 2大规模EST特征 2．文库构建及韧步分析 本实验室以家蚕品种“大造”为材料，选取五龄幼虫重要组织丝腺、中肠、脂肪体、体液、生 殖腺和发育期胚胎共构建12个非偏性cDNA文库，5’端方向大规模测序，获得81625个合格的EST 序列，Phrap软件拼接获得24678个非冗余序列(UniGene)