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四川大学硕士学位论文吉林省汉坦病毒的分离及进化分析
四川大学硕士学位论文
吉林省汉坦病毒的分离及进化分析
硕士研究生: 陈宪
导 师: 陈建平教授
中文摘要
汉坦病毒(Hantavirus,ttV)属于布尼亚病毒科(gunyyaviridae)汉坦病 毒属(Hantavirus),是一有包膜的分节段的负链RNA病毒。Hv基因组由大 (Large,L)、中(Medium,M)、d%Small,S)三个片段组成。L片断长6530~6550bp, 编码病毒特异的依赖RNA的RNA聚合酶;M片断大小3613—3707bp,编码G蛋 白前体(GPC);S片断由1696—2083bp组成,编码病毒的核衣壳蛋白(NP)”“。 汉坦病毒一个主要特征是每一型的Hv都有一个独特的啮齿动物宿主(除
TPM株。”以外)。汉坦病毒可在其宿主中长期存在而不表现症状,并与宿主共进 化”“。人主要通过接触带毒宿主动物及其分泌物和排泄物所形成的气溶胶而 感染。人感染Hv后可引起两种死亡率很高的疾病:肾综合征出血热 (Hemorrhagic Fever with Renal Syndrome,口RS)和汉坦病毒肺综合征 (Hantavirus PuImony Syndrome,HPS)。
目前,已有23种汉坦病毒的血清型/基因型被确定“”。我国流行的主要是 I(HTN)型和II(SEO)型汉坦病毒。最近有报导在我国发现普马拉(PLY)型 汉坦病毒圳。
本研究共分为两个部分: I、用直接免疫荧光法检测从吉林省不同疫区采集的褐家鼠鼠肺标本,共
得到55份阳性标本,阳性率为9.35%;将其中4个阳性标本(Jilinl050、
Jilinl055、Jilinl056和Jilinl060)作RT—PCR检测,结果为SEO(II)型病
四川大学硕士学位论文毒;用Vero—E6细胞分离得到一株病毒,命名为cJilinl050/Rn/2002,简称
四川大学硕士学位论文
毒;用Vero—E6细胞分离得到一株病毒,命名为cJilinl050/Rn/2002,简称
CJilinl050。
2、用直接免疫荧光和RT—PCR方法检测从吉林省不同疫区采集的大林姬鼠 鼠肺标本,共得到4份阳性标本。从中分离出2株病毒,分别命名为 CJilin89/Ap/2002(简称CJilin89)和cJi]in93/Ap/2002(简称cjilin93)。将
cJJlin93株全M基因片断克隆、测序,并进行进化分析,结果显示:cJiIin93 株的M基因全长3577bp,编码一个含有1135个氨基酸的G蛋白前体(GPc): CJi l in93株与分离自黑线姬鼠的Baol4株病毒同源性最高,核苷酸同源性为 97.2%,氨基酸同源性为99.3%,而与同样分离自俄罗斯远东地区大林姬鼠的 AMR类病毒的同源性较远;构建的系统发生树也表明C3i l in93株与Baol4株共 处同一分支。因此推测,在我国东北地区和俄罗斯远东地区的大林姬鼠中可能 携带不同种系的汉坦病毒。
关键词:大林姬鼠褐家鼠汉坦病毒M基因
基金项目:国家科技部社会公益项目专项基金重点项目《我国流行性出血热分
子流行病学研究》(2001DIA400)
四川I大学硕士学位论文Isolation
四川I大学硕士学位论文
Isolation and Sequence Analysis of Hantavirus from
Jilin in Northeast of China
Graduate Student CHEN X i an
Tutor OHEN Jian Ping
Abstract
Hantavirus,which belonging to the genus Hantavirus of the fami ly Bunyaviridae,is an eveloped negative—strand RNA virus with a tripartite segmented genome.The large(L)segment of 6530—6550bp encodes the viral
ENA polymerase,the medium(m)segment of 3613—3707bp encodes a glycoprotein precursor(GPC)that is cotranslationally cleaved to yield two surface glycoproteins(G1、G2),and the smali(S)segment of 1696—2083bp encodes nucleocapsid protein(NP).
The natural host of hantavirus is mainly
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