北京大学生物化学课件基因组学与医学.pptxVIP

刘新文;第一节 基因组学概念及研究范畴（The Concept and Research Categories of Genomics）;一、基因组学概念;人类基因组计划（human genome project, HGP）：一项多国合作的国际研究计划，旨在阐明人类基因组DNA 3×109bp的序列，发掘所有人类基因，确定其在染色体上的位置，从而破译人类的全部遗传信息。HGP还对包括大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇、拟南芥和小鼠等在内的一系列模式生物体基因组的测序。 ;结构基因组学（structural genomics）：通过基因作图、核苷酸序列分析确定基因组成、基因定位的科学。 ;三、基因组学主要研究技术 ;第二节 结构基因组学（Structural Genomics）;一、人类基因组作图;第一代DNA多态性标志：限制性片段长度多态性（RFLPs）、随机引物扩增多态性 (RAPD) 、扩增片段长度多态性(AFLP) ;2、物理作图（physical mapping）： 确定遗传标志间的物理距离，一般用bp/kb/Mb表示。 1cM的遗传距离大致上相当于1Mb的物理距离。;1. 基于BAC连续克隆系的测序 ;第二节 功能基因组学（Functional Genomics）; 1. 概念：利用结构基因组学提供的信息，以高通量，大规模实验方法及统计与计算机分析为特征，全面系统地分析全部基因及其编码蛋白的功能。包括：生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。;转录组(transcriptome)：指一个细胞内的一套mRNA转录物，包含了在某一环境条件、某一生命阶段、某一生理或病理（功能）状态下，生命体的细胞或组织所表达的基因种类和水平。 ;第三节 比较基因组学(Comparative Genomics);第四节 基因组学与医学(Genomics and Medicine);一、“基因病” ( Gene Disease)的概念;二、疾病相关基因的鉴定;三、基因检测(Gene Testing) 基因检测：适应分子医学发展需要产生的一种新型的个体基因异常检测手段，直接检测DNA。;四、药物靶标和药物设计 ;第一节 概 述;;真核生物基因组的特点 1. 基因组含有更大的DNA分子，以染色体形式储存于细胞核内，体细胞内的基因是双份的。;高度重复序列（105次） （1）卫星DNA(satellite)： 小卫星DNA(可变数目串联重复序列，VNTRs) ：重复长度5-50bp，重复次数可变，有高度特异性。 微卫星DNA(MS；又称简单串联重复序列，STRs)：重复长度1-4bp，主要为二核苷酸重复序列如（CA）n，存在个体间的高度变化，是DNA指纹的形成基础。;;单一序列 单拷贝，在基因组中占50-80％，人基因组中约有60-65％的单一序列。;多基因家族（multigene family）：亦称基因家族，是指一组具有类似功能，核苷酸序列又有同源性的基因。 超基因家族（supergene family）：由多基因家族及单基因组成的更大的基因家族。成员间有不同程度的同源，但功能并不相似。如Ig超家族。 ;（4）假基因：在多基因家族中，不产生有功能产物的基因。即序列与有功能的基因相似，但或者不能转录，或者转录后生成无功能的基因产物。用Ψ表示。假基因往往缺少正常基因的内含子，两侧有顺向重复序列。;8. DNA序列组织的可变性（基因组不稳定性） (1) 基因重排;人类基因组计划是由美国科学家于1985年率先提出、于1990年正式启动的。旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序，发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息 。 美国、英国、法国、德国、日本和中国科学家共同参与了这一价值达30亿美元的研究计划。;20世纪科学史上三个里程碑:曼哈顿原子弹计划、人类登月计划、人类基因组计划(HGP) ;基因组学：以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为研究手段，以生物体内全部基因为研究对象，在全基因背景下和整体水平上探索生命活动的内在规律及其内外环境影响机制的科学。;4、基因组学研究的常用方法 (1) 脉冲场凝胶电泳（PFGE） (2) 毛细管电泳 (3) 基因芯片技术;一、概念和目的 以全基因组测序为目标的基因结构研究，弄清基因组中全部基因的位置和结构，为基因功能的研究奠定基础。其目的是建立高分辨的遗传图谱、物理图谱和序列图谱。;遗传信息在染色体上，但染色体不能直接用来测序，必须将基因组这一巨大的研究对象进行分解，使之成为较易操作的小的结构区域，这个过程就是基因作图。 根据使用的标志和手段不同，有4种作图类型：遗传图谱、物理图谱、序列图谱、基因图谱。 ;敲碎基因组，分析目的片段所处的染色体位置