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10 PubChem
PubChem是NIH设立分子图书馆以及开展研究小分子化学、结构和生物学特性工作的基础。三个Entrez
数据库—— PCSubstance 、PCCompound和PCBioAssay收录了所有的相关信息。这三个数据库共收录有将
近4 100万条小分子记录和1900万种结构。其中750,000条记录都在PubChem中收录的1200种生物检测方法中
的至少一种生物检测试验中具有活性。PubChem不仅与PubMed 、PMC等Entrez数据库有链接,还与Entrez
Structure和Entrez Protein有链接,这样就将基因组水平的生物大分子与细胞代谢水平的小分子联系起来了。
用户可以使用文本在PubChem数据库中进行搜索,也可以使用各种格式的化学分子式或化学结构进行搜索。
更多信息
用户可以在NCBI Bookshelf 中找到NCBI手册,该手册详细的介绍了NCBI中的各种资源。在NCBI的主
页上还有 “教育 (Education )”链接,其中有多个教程可供用户学习。用户还可以通过网站地图了解NCBI
中的各种资源。在 “About NCBI”网页上还有生物信息学入门和其它补充资源。NCBI还设有面向用户的服
务人员回答各种问题,用户可以发邮件到info@ 向他们提问。/About/
newsletter.html网页上还有NCBI最新的更新信息。用户还可以到/Sitemap/Summary/
email_lists.html订阅各种更新信息邮件。NCBI现在还设有RSS服务。
原文检索:Nucleic Acids Research , 2009, Vol. 37, Database issue D5–D15
YORK /编译
二 蛋白序列数据库
全球蛋白资源数据库UniProt (2009更新)
UniProt是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相
互联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广
泛、功能注释最全面的一个数据库。UniProt是由欧洲生物
信息学研究所 (European Bioinformatics Institute )、美国
蛋白质信息资源 (Prontein Information Resource )以及瑞
士生物信息研究所 (Swiss Institute of Bioinformatics )等
机构共同组成的UniProt协会 (UniProt Consortium)编辑、
制作的一个信息资源,旨在为从事现代生物研究的科研人员
提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的广泛的、高质
量的并可免费使用的共享数据库。
图片来源:UniProt
UniProt是一个向所有使用者免费开放的数据库,全球
科研人员都可以登陆网站www.uniprot .org浏览并下载这些
资料。借助它,科研人员可以对目的蛋白进行交互式分析或
特定的分析。
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