分析蛋白质化学的三维结构方程.pptVIP

第三章 蛋白质化学（续） 蛋白质的三维结构 稳定蛋白质三维结构的作用力 P201 稳定蛋白质三维结构的作用力主要是一些非共价键或次级键，包括氢键、范德华力、疏水作用和盐键（离子键） 蛋白质分子中的非共价键(次级键) 1. 氢键P202： 氢键(hydrogen bond)的形成常见于多肽主链上的羰基氧和酰胺氢之间。 氢键在维系蛋白质的空间结构稳定上起着重要的作用。 氢键的键能较低(~12kJ/mol)，因而易被破坏。 2．范德华氏（van der Waals)引力P202： 这是一种普遍存在的作用力，是一个原子的原子核吸引另一个原子外围电子所产生的作用力。它是一种比较弱的、非特异性的作用力。 范德华力包括引力和排斥力，其中作用势能与1/R6成正比的三种作用力（静电力、诱导力和色散力）通称为范德华引力。 3. 疏水键P203： 非极性物质在含水的极性环境中存在时，会产生一种相互聚集的力，这种力称为疏水键或疏水作用力。 4. 离子键（盐键）P204： 离子键(salt bond)是由带正电荷基团与带负电荷基团之间相互吸引而形成的化学键。 在近中性环境中，蛋白质分子中的酸性氨基酸残基侧链电离后带负电荷，而碱性氨基酸残基侧链电离后带正电荷，二者之间可形成离子键。 5、二硫键 P204 二硫键的形成并不规定多肽链的折叠。然而一旦蛋白质采取了它的三维结构则二硫键的形成将对此构象起稳定作用。 在绝大多数情况下，二硫键是在多肽键的β转角附近形成的。 蛋白质结构的层次 一级结构：氨基酸序列 二级结构：α螺旋，β折叠 超二级结构 结构域（domain） 三级结构：所有原子空间位置 四级结构：蛋白质多聚体 蛋白质的二级结构 P207 （一）概念 ：指蛋白质多肽链主链局部的空间结构，不涉及氨基酸侧链残基的构象。 稳定因素：氢键 （三）二级结构的主要构象方式 1、α螺旋 （1）α螺旋的一般特征： ★多肽主链按右手或左手方向盘绕，形成右手螺旋或左手螺旋， ★相邻的螺圈之间形成链内氢键 ★构成螺旋的每个Cα都取相同的二面角Φ、Ψ。 右手α-螺旋与左手α-螺旋 右手螺旋比左手螺旋稳定。 蛋白质中的α—螺旋几乎都是右手，但在嗜热菌蛋白酶中有很短的一段左手α—螺旋，由Asp-Asn-Gly-Gly（226-229）组成（φ+64°、Ψ+42°）。 α螺旋结构要点： ① 每圈螺旋：3.6个a.a残基，高度：0.54nm ② 氨基酸残基侧链向外 ③ 相邻螺圈之间形成链内氢链，氢键的取向几乎与中心轴平行。 ④ 每个肽基上C=O和其前面第3个肽基上的N-H间形成氢键。 影响α-螺旋稳定的因素有： ⑴ 极大的侧链基团（存在空间位阻）； ⑵ 连续存在的侧链带有相同电荷的氨基酸残基（同种电荷的互斥效应）； ⑶ 有Pro等亚氨基酸存在（不能形成氢键）。 2、?? β-折叠 两条或多条几乎完全伸展的多肽链（或同一肽链的不同肽段）侧向聚集在一起，相邻肽链主链上的NH和C=0之间形成氢链，这样的多肽构象就是β-折叠片。 β-折叠结构特点 （1）氢键与肽链的长轴接近垂直。 （2）多肽主链呈锯齿状折叠构象 （3）侧链R基交替地分布在片层平面的两侧。 3、β-转角（β-turn） 球状蛋白质分子中出现的180°回折，由第一个a.a残基的C=O与第四个氨基酸残基的N-H间形成氢键。 4、无规卷曲（random coil）P212 没有规律的多肽链主链骨架构象。 这种有序的非重复结构经常构成酶活性部位和其他蛋白质特异的功能部位，往往与生物活性有关 纤维状蛋白质 P212 纤维状蛋白质(fibrous protein)广泛地分布于脊椎和无脊椎动物体内，它是动物体的基本支架和外保护成分，占脊椎动物体内蛋白质总量的一半或一半以上。 纤维状蛋白质可分为不溶性(硬蛋白)和可溶性二类： 前者有角蛋白、胶原蛋白和弹性蛋白等； 后者有肌球蛋白和纤维蛋白原等，但不包括微管(microtubule)、肌动蛋白细丝(actin filament)或鞭毛( flagella)，它们是球状蛋白质的长向聚集体(aggregate)。 1、?? 角蛋白 源于外胚层细胞，包括皮肤及皮肤的衍生物（发、毛、鳞、羽、甲、蹄、角、爪、丝）。 α-角蛋白，β角蛋白。 （1） α-角蛋白（毛发） 主要由α-螺旋结构组成 三股右手α-螺旋向左缠绕形成原纤维，原纤维排列成“9+2”的电缆式结构称微纤维，成百根微纤维结合成大纤微。P213 角蛋白的结构特征 （2）?-角蛋白(丝心蛋白) （2）β-角蛋白（丝心蛋白） 2、?? 胶原蛋白 胶原蛋白或称胶原(c