第四章遗传作图-周玉亮.ppt

* * * * * * 水稻遗传图谱 基因难以识别，遗传标记容易识别 通过遗传标记构建的“基因组版图”可以方便的找到基因。 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 4.6.1 连锁分析 * * 单交换 * * 双交换 三个基因之间发生双交换的话，可以简单理解为中间那个基因的位置发生了交换，而两边的基因位置不变。 每个双交换都包括两个单交换，双交换发生的概率肯定小于单交换。 * * 基因型 数目 类型 重组事件 特点 ABC/abc 351 abc/abc 342 aBC/abc 36 Abc/abc 40 ABc/abc 115 abC/abc 107 AbC/abc 9 aBc/abc 11 总数 1011 三点测验(p75)：AaBbCc与aabbcc的测交结果如下表 * * * * 问题1：AaBbCc可以形成几种类型的配子？ A B C a b c a B C A b c A B c a b C A b C a B c 问题2（关键）：如何给配子分类 亲本型：数量最多 单交换1：数量居中 单交换2：数量居中 双交换：数量最少 * * 基因型 数目 类型 重组事件 特点 ABC/abc 351 abc/abc 342 aBC/abc 36 Abc/abc 40 ABc/abc 115 abC/abc 107 AbC/abc 9 aBc/abc 11 总数 1011 三点测验：AaBbCc与aabbcc的测交结果如下表 数量最多 数量居中 数量居中 数量最少 亲本型 单交换1 单交换2 双交换 无 A与B之间 B与C之间 A与B和 B与C之间 * * 1.如何将测交后代分组？测交后代个数接近的两个分为一组。 2.如何确定亲本型配子？测交后代中个体数最多。 3.如何确定双交换？测交后代中个体数最少的，双交换个体中发生交换的那个基因位于三个基因的中间。 4.如何确定单交换？和亲本型的基因型比较，单交换个体中发生交换的基因位于三个基因的两端的位置。 * * * * 凹陷、非糯性、有色 shsh + + + + 饱满、糯 性、无色 + + wx wx c c 饱满、非糯性、有色 + sh + wx + c 凹陷、糯 性、无色 shsh wxwx cc 测交结果见下表 举例：玉米Cc、Shsh和Wxwx三对基因的定位。 P1 P2 F1 杂交 测交 × × * * 测交后代的表现型 据表型推测基因型 测交后代的个体数 交换类别 饱满、糯 性、无色 凹陷、非糯性、有色 + wx c sh + + 饱满、非糯性、无色 凹陷、糯 性、有色 + + c sh wx + 凹陷、非糯性、无色 饱满、糯 性、有色 sh + c + wx + 饱满、非糯性、有色 凹陷、糯 性、无色 + + + sh wx c 总数 亲本型 单交换 单交换 双交换 2708 2538 626 601 113 116 4 2 6708 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 通过比较双交换和亲本基因型可知： sh 位于三个基因的中间位置。 三个基因之间的距离如何计算？？ * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 4.6. 2 交换干扰与作图函数 (1) 交换干扰 如果各个交换事件是独立的，根据概率定律，双交换出现的频率就应等于两个单交换频率的乘积。 干扰：即一个单交换发生后, 在它邻近再发生第二个单交换的机会就会减少。 * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 ●符合系数 对于受到干扰的程度，通常用符合系数来表示: * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 ●干扰值I=1-C 当I=0时，没有干扰，C=1。当I=1时，则没有双交换发生, 发生完全干扰。 大多数情况下0I1。但在一些特殊情况下，实际观察值比理论值大，称为负干扰，即一个单交换发生可提高另一单交换发生的频率。 * * 第4章 遗传作图-- 4.6 遗传图构建 (2)作图函数（mapping function）: 真实的遗传图距与重组率之间的函数关系。 *