Cytoscape软件画图说明.docxVIP

Cytoscape软件画图说明 1、画图前，先准备两个输入文件。 2、打开cytoscape软件，导入数据。 导入edge.txt文件 点击File ----Import ----Network 连接类型，文件中第3列 连接类型，文件中第3列 节点1，文件中第一列 节点2，文件中第2列 点击ok得到原始图形 点击layout ----Apply Preferred Out 改变图形排列方式 此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。 改变画布背景。点击左侧Contro Panel ----Style---network ---Backgroud paint 设置节点之间连线的宽度和颜色 Contro Panel ----Style---Edge 颜色宽度 颜色 宽度 导入node.txt个文件 点击File ----Import ----Table 设置节点图形属性 Contro Panel ----Style---Node 1、node大小 通过设置Height和Width来控制大小 2、Node性状 通过设置Shape来控制 3、Node填充色 通过设置Fill Color来控制 4、Node标签的设置 点击Properties -- Label Position 点击Label Position来设置标签位置。这里是一个示范操作，要细致调整标签位置还是要设置Column和Mapping Type两个参数。 设置完成之后图形 调节节点之间的距离 点击layout ----Scale 鼠标拖动 鼠标拖动 最后，画图导出成pdf文件 点击File ----Export----Network View as Graphics