从基因组学、系统生物学到转化医学朱鼎良.ppt

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2019-04-30 发布于江西
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从基因组学、系统生物学到转化医学朱鼎良.ppt

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血管老化的防治 - 研制中的药物 AGE breaker Alagebrium (ALT711) 端粒酶激活剂 farnesyl transferase inhibitors 上调 lamin A生成 - Nilsson PM, Laurent S, et al. Hypertension 2009;54:3-10 中国人群高血压全基因组关联研究（GWAS）第一阶段——方法（小样本，严格入组标准）病例 1）原发性高血压患者：SBP≥140mmHg 和/ DBP≥90mmHg，（447例）或正在服用降压药物； 2）具有明确的高血压家族史，家族中至少两人患有高血压病； 3）发病年龄30岁； 4）体质量指数（BMI） 25kg/m2; 5）不具有糖尿病家族史，空腹血糖7.0mmol/L; 6）排除继发性高血压，心力衰竭，肝肾功能衰竭，恶性肿瘤。对照 1）未被诊断过高血压病，且血压120/80mmHg ；（455例） 2）年龄40岁； 3） BMI 27kg/m2,空腹血糖7.0mmol/L; 4）排除糖尿病，心脏疾病，肾脏疾病，恶性肿瘤。中国人群高血压全基因组关联研究（GWAS）第一阶段——方法芯片：Ilumina Human 610-Quad, 620,901 SNPs 筛选位点的质量控制标准: ? 最小等位基因频率 MAF 1% ; ? 基因型检出率 = 97% (MAF5%的SNP = 99% ) ? 对照组的Hardy-Weinberg 平衡检验 p 1e?5 符合质量控制标准的SNP共有590,761个。人群结构评估：主成分分析显示研究所用高血压患者及对照来自同一人群。中国人群高血压全基因组关联研究（GWAS） SNP ID Chr Position Nearest Gene P MAF Beta s.e. SBP r9TLE1 2.60E-06 0.020 21.26 4.49 r9TLE1 3.33E-06 0.019 21.65 4.63 rs7869544 9TLE1 3.33E-06 0.019 21.65 4.63 rs2622790 18SYT4 5.78E-06 0.375 6.06 1.33 rs1991867 16CDH13 7.01E-06 0.302 6.39 1.41 rs1120367 9TLE1 7.58E-06 0.022 19.55 4.34 rs6141008 20 9618903 PAK7 8.65E-06 0.194 -7.44 1.66 rs2256663 18SYT4 9.30E-06 0.377 5.93 1.33 DBP rs2087625 10ZNF365 1.48E-06 0.143 5.55 1.14 rs7092664 10ZNF365 2.50E-06 0.144 5.42 1.14 r2 105449596 LOC728966 3.08E-06 0.062 7.81 1.66 rs3864811 10ZNF365 3.12E-06 0.144 5.38 1.15 rs2572272 18SYT4 3.59E-06 0.433 3.76 0.81 rs7086545 10ZNF365 3.63