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实时定量PCR法预测禾谷丝核菌Rhizoctonia.PDF
微生物学通报 Sep. 20, 2014, 41(9): 1917−1923
Microbiology China © 2014 by Institute of Microbiology, CAS
tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.130869
生物实验室
实时定量PCR 法预测禾谷丝核菌Rhizoctonia
cerealis 基因组大小
1,2 2 2 2 2 2* 1*
张春燕 李伟 孙海燕 邓渊钰 张爱香 陈怀谷 王志伟
(1. 210095)
(2. 210014)
摘 要【目的】准确测定基因组大小是进行禾谷丝核菌Rhizoctonia cerealis 全基因组序列测定
和拼接的基础，本研究旨在利用实时定量 PCR 方法预测禾谷丝核菌的基因组大小。【方法】首
先克隆了禾谷丝核菌R0301 菌株翻译延伸因子A 基因(tef A)的部分序列，Southern 杂交明确该
基因在该病菌基因组中为单拷贝。以已测序立枯丝核菌(Rhizoctonia solani) AG1-IA 融合群菌株
GD118 为对照，采用实时定量PCR 的方法进行了禾谷丝核菌基因组大小的预测。【结果】实时
定量PCR 的方法可以比较准确的测定立枯丝核菌基因组的大小，研究首次预测了禾谷丝核菌的
基因组大小位于32.2–36.6 Mb 之间。【结论】实时定量PCR 法是一种快速和简便的预测丝核菌
基因组大小的方法。
关键词禾谷丝核菌，基因组大小，翻译延伸因子A ，单拷贝，实时定量PCR
Genome size estimation of Rhizoctonia cerealis with quantitative
real-time PCR
ZHANG Chun-Yan1,2 LI Wei2 SUN Hai-Yan2 DENG Yuan-Yu2 ZHANG Ai-Xiang2
CHEN Huai-Gu2* WANG Zhi-Wei 1*
(1. College of Life Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095, China)
(2. Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing, Jiangsu 210014, China)
Abstract: [Objective] Understanding the genome size of Rhizoctonia cerealis is the basis for the
genome sequencing and assembly. In this study, we estimated the genome size of R . cerealis via the
quantitative real-time PCR method. [Methods] The partial translation elongation factor A gene (tef
A) of R . cerealis strain
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