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成团泛菌依赖型磷酸甘油酸变位酶基因的克隆、序列分析及产
氢中的差异表达
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马颖超 , 朱大玲 , 王广策
(1. , , 300457; 2.
, 266071)
摘要: 为研究高效产氢菌株成团泛菌(Pantoea agglomerans)BH-18 中依赖型磷酸甘油酸变位酶
(cofactor-dependent phosphoglycerate mutase, dPGM)与产氢之间的关系, 本研究根据GenBank 上已登录
的肠杆菌中编码dPGM 的基因序列设计一对引物, 从细菌基因组 DNA 中克隆得到编码dPGM 基因的
完整开放阅读框, 其长度为753 bp, 编码250 aa 。采用BLAST 对其与NCBI GenBank 中的核苷酸序列
进行比较分析, 结果表明该基因保守性相对较高, 与肠杆菌科众多菌株中的 dPGM 基因相似性达
100%。采用Bioedit 和Mega4 软件构建NJ 系统进化树, 结果表明成团泛菌BH-18 的dPGM 氨基酸序
列与Enterobacter asburiae 的dPGM 聚为一类, 而与成团泛菌属中其他菌株的该蛋白关系较远, dPGM
的氨基酸序列在属内不保守。最后, 根据已获得的基因序列设计引物, 采用RT-PCR 的方法分析了成团
泛菌BH-18 产氢过程中dPGM 基因的转录情况, 结果表明dPGM 基因的转录与产氢呈正相关, 依赖型
磷酸甘油酸变位酶是产氢过程中的关键酶。
关键词: 成团泛菌(Pantoea agglomerans); 依赖型磷酸甘油酸变位酶; 基因克隆; 序列分析; 产氢
中图分类号: Q939.99 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2013)06-0060-06
(phosphoglycerate mutase, , PGM
PGM; EC), , PGM
3- (3-phosphoglycerate, 3-PGA) , , PGM ,
2- (2-phosphoglycerate, 2-PGA)
[1-2] PGM : ,
(cofactor-dependent phosphoglycerate (Pantoea agglomerans)BH-18
mutase, dPGM), (cofactor) 2,
3- (2, 3-bisphosphoglycerate, 2, [10]
3-BPGA), ,
, BH-18 ,
; dPGM, ,
(cofactor-independent phosphoglycerate mutase, iPGM), RT-PCRBH-18
2, 3-BPGA , dPGM,
, ,
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