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物理学报 Acta Phys. Sin. Vol. 62, No. 10 (2013) 107102 扩环荧光碱基类似物x- 腺嘌呤分子基态和激发态 性质的理论研究* 1 12† 张来斌 任廷琦 1) ( 曲阜师范大学物理工程学院, 曲阜 273165 ) 2) ( 山东科技大学理学院, 青岛 266590 ) ( 2012年11月13 日收到; 2013年1月11 日收到修改稿) 近年来, 设计合成荧光碱基类似物成为科学家研究的一个热点. 利用含时密度泛函理论考察了腺嘌呤类似物x- 腺嘌呤的电子激发态性质, 计算了其电子吸收光谱和荧光光谱, 并对其若干低能电子激发态进行了详细解析归属. 同时考察了甲醇溶剂、糖环和与胸腺嘧啶配对对其光谱性质的影响. 研究表明, 在低能区域, x- 腺嘌呤的吸收光谱 与天然腺嘌呤相比发生了很大红移, 使其可以被选择性地激发. 计算得到的吸收光谱和荧光光谱与实验值符合很好. 溶剂化和糖环对x- 腺嘌呤的电子吸收光谱具有增色效应, 同时发现溶剂化和糖环均使其荧光发生红移, 而碱基配对 对其最低激发态∗ 和荧光发射无显著影响, 但使其最低n∗ 态发生显著蓝移. 关键词: x- 腺嘌呤, 电子吸收光谱, 荧光光谱, 含时密度泛函 PACS: 71.15.Mb, 71.10.Li, 71.20.Rv DOI: 10.7498/aps.62.107102 基配对形成稳定的双螺旋结构(xDNA), 而且它们 1 引言 的最高占据轨道(HOMO)- 最低空轨道(LUMO) 能 差比天然碱基小, 表明它们在生物器件方面具有潜 核酸作为生命的最基本物质, 是生命科学中最 10 在的应用价值 . 我们比较感兴趣的是这种扩环 主要的研究课题之一. 随着分子生物学和基因组学 修饰增大了分子体系的 共轭, 有可能产生新颖的 的发展, 人们对核酸的研究更加关注, 其不仅成为 光学性质. 实验表明, 与天然碱基相比, 这些扩环碱 生命科学领域的前沿问题, 也成为化学、物理学和 56 基都具有强烈的荧光 , 这表明它们在作为荧光 材料科学等众多交叉学科领域的热点课题. 众所周 探针用以研究DNA/RNA 杂化以及DNA- 蛋白质相 知, 天然碱基虽然在紫外区域有强吸收, 但是其荧 互作用方面具有潜在的应用价值. 利用理论模拟技 光产率很低, 这种性质对经常受日光辐射的生物体 术可以从分子的微观性质方面解释相关实验现象, 具有保护作用. 因此要利用荧光光谱技术来研究 DNA 与环境的相互作用, 必须利用高荧光产率的 推算及预测新产品及材料的介观、宏观性质, 已经 碱基类似物. 近年来, 设计合成非天然碱基成为科 成为新的学术方向. 本文利用含时密度泛函理论对 学家研究的一个热点, 因为这些分子在生物技术、 腺嘌呤类似