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雉科鸟类肠道微生物的多样性与功能及其对食性的.pdf

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第39卷第2期 南京师大学报(自然科学版) Vol.39 No.2 2016年6月 JOURNALOFNANJINGNORMALUNIVERSITY(NaturalScienceEdition) June,2016 doi:10.3969/j.issn.1001-4616.2016.02.017 雉科鸟类肠道微生物的多样性与功能 及其对食性的适应 1 1 1 1 2 1 沈佳斌 ,张雪敬 ,吴 蔚 ,胡婉婷 ,张成林 ,朱立峰 (1.南京师范大学生命科学学院,江苏南京210023) (2.北京动物园,北京 100000) [摘要] 肠道菌群对动物的生命活动有着极其重要的影响.本研究利用高通量测序手段,对雉科(Phasianidae) 鸟类粪便进行 16SrRNA基因测序,并结合其自身的杂食性饮食结构,探究了雉科鸟类肠道菌群的情况,共得到 189860条有效序列并定义4305个OTU(OperationalTaxonomicUnit).结果发现雉科鸟类肠道菌群中变形菌门 的相对丰度高于许多已知的其他鸟类.尽管食性相同,但雉科鸟类肠道菌群依然存在部分分化的现象,说明宿 主系统发生地位对肠道菌群结构起到了重要的作用.不仅如此,更深入的宏基因组研究显示,雉科肠道菌群功 能中,分解雉科摄入的有害物质的通路被富集,以此来确保雉科鸟类的正常生命活动. [关键词] 肠道菌群,雉科,功能 [中图分类号]Q958;Q938 [文献标志码]A [文章编号]1001-4616(2016)02-0090-06 TheGutMicrobes’DiversityandFunctionofPhasianidae ProvideInsightsontheAdaptationtoTheirDiet 1 1 1 1 2 1 ShenJiabin ,ZhangXuejing ,WuWei ,HuWanting ,ZhangChenglin ,ZhuLifeng (1.SchoolofLifeSciences,NanjingNormalUniversity,Nanjing210023,China) (2.BeijingZoo,Beijing 100000) Abstract:Intestinalfloraplaysanimportantroleonthelifeactivitiesofanimals.Inthisstudy,highthroughput 16S rRNAgenesequencingmethodonfeceswasusedtoinvestigatetheintestinalfloraofPhasianidaebirdsconsidering theiromnivorousdietstructure.Thestudytotallygained 189860sequencesanddefined4 305OTUs.Itwasfoundthat thegutmicrobesofPhasianidaebirdshadrelativehighproportionofProteobacteriacomparedwiththosefromother birds.Althoughtreatedwiththesamediet,itwasstillfoundthepartialdivergenceontheirgut

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