绿豆慢生根瘤菌的多样性研究-微生物学专业毕业论文.docxVIP

绿豆慢生根瘤菌的多样性研究摘要 绿豆慢生根瘤菌的多样性研究 摘要 本研究采用表型性状测定、16S rDNA-RFLP、16S rDNA序列分析，16S．23S rDNA IGS RFLP分析以及RAPD分析等技术系统首次研究了从我国不同地域分离的44株绿 豆根瘤菌的遗传多样性及其在根瘤菌系统发育中的地位和相互关系。 表型聚类结果可以看出：在84％的相似性水平上，44株供试根瘤茵和参比菌株 可分为I、Ⅱ和Ⅲ三个群。在78％的水平上各群可进一步划分为不同的亚群：群1 分为1和2两亚群，是由13个分别来自于连云港、石家庄以及一株邯郸的未知菌组 成；群Ⅱ分为3和4两个亚群。亚群3主要由来自连云港和邯郸的菌株组成，还包 括BradyrhizobiumjaponicumUSDAllO；亚群4由来自新疆和四川等地的菌株和参比 菌株Brad)，rhizobiumliaoningense 2281共同组成；群m主要由来自南方如广东和广 西的菌株组成，他们与参比菌株Bradyrhizobium elkanii USDA76、USDA46、USDA86 聚在一起。 16S rDNAPCR-RFLP分析表明：在76％的相似水平上，所有供试菌株可分为三 大类群；群I由LYGl等13株慢生根瘤菌组成，该群在系统发育上与且japonicum 和且liaoningense的参比菌株存在一定的差异；群Ⅱ由XJl等21株供试菌株、且 japonicum和13．1iaoningense的代表菌株组成；群Ⅲ由10株来自广东和广西的菌株 和最elkanii的代表菌株组成。 16S．23S rDNA IGS PCR．RFLP分析将供试菌株分为A、B两大群。群A由34 株供试菌株、且japonicum和13．1iaoningense的代表菌株组成。在85％的相似性水平 上，可再分为AI、AII和AIII三个亚群；群B由10株分离自广西和广东的菌株和 且elkanii的代表菌株组成。在85％的相似性水平上，可再分为BI和BII两亚群，表 现出一定的多样性。与16S rDNA PCR．RFLP相比，16S．23S rDNA IGS PCR．RFLP 具有更高的解析度，供试菌株表现出更加丰富的遗传多样性。分离自我国新疆、广 东和广西等地的菌株在分群上具有较为明显在地域特征。 RAPD分析结果表明：在89％的相似性水平上，所有供试绿豆根瘤菌和参比菌 株可分为a、b、c、d、e、f和g共7个亚群，提供了较高的解析度。并且从结果可 以看出和表型聚类、16S rDNA PCR．RFLP以及16S．23S rDNAIGS RFLP的聚类结果 均保持了较高的一致性。同时地理因素对根瘤菌的分群有较大的影响。 关键词：慢生根瘤菌；生物多样性；系统发育；限制性片段长度多态性；随 机扩增多态性DNA 华中农业大学2006届硕士学位论文Abs；tract 华中农业大学2006届硕士学位论文 Abs；tract Studies on diversity and phylogeny of slow-growing rhizobia isolated from M秽口 radiata in China was conducted by using phynotype，16S rDNA gene PCR—RFLP，16S rDNA gene sequencing，16S·23S rDNA IGS PCR-RFLP and RAPD assays． Results of phenotype test shown that all 44 rhizobia tested and 7 reference strains were clustered into three groups(LII．IIn which were furthered divided into subgroups at the similarity of 78％．Group I include subgroup 1 and 2 which contained 13 slow-growing rhizobia isolated from Lianyungang,Shijiazhuang and Handan．Group II consisted of Subgroup 3 and Subgroup 4．The former included strains isolated from Liangyungang，Handan and且japonicumUSDAllO and the later included strais from Xinjiang and Sichuan and reference strain且liaoningense22