紫花苜蓿油菜素内酯基因DWF4的生物信息学分析Bioinformatics.pdfVIP

中国农业科学院 Chinese Academy of Agricultural Science 紫花苜蓿油菜素内酯基因DWF4的生物 信息学分析 Bioinformatics analysis of brassinolide DWF4 in Medicago Sativa 汇报人：刘文文 日 期 主要内容 1 目的及背景 2 基因功能分析 3 3 蛋白结构分析 4 总结 研究背景——紫花苜蓿 紫花苜蓿被誉为“牧草之王”, 是世界上分布最广、 最古老的栽培牧草, 也是我国种植面积最大的人工牧草。 而产量是紫花苜蓿长期以来的主要育种目标之一。 研究背景——DWF4基因的发现 1998年，Choe等人就从一个拟南芥T-DNA插入突变体中鉴定得到 DWF4基因，DWF4基因的突变体具有许多特别明显的表型，首先 突变体植株生长速度相对较缓，它的叶片小而聚集。（Azpiroz et al.1998 ） 研究背景——DWF4基因功能 DWF4基因在模式植物拟南芥当中是编码细胞色素氧化酶CYP90B 1， 是BR （油菜素内酯）合成限速酶基因。 Campestanol和6-deoxo cathasterone能够使突变体表型恢复，其他中间产物 和植物激素都不可以，该试验说明DWF4基因所编码的细胞色素氧化酶在BR合 成路径中催化的是C-22经化反应(Choe etaL 1998)。 在拟南芥DWF4突变体中定量检测到有较高含量的C-22羟化反应的前体物质 的累积，表明CYP90B 1主要是用来催化C-22羟基化反应过程的。 DWF4基因通过异位表达能够显著提高植物体内羟基化BR （油菜素内酯）的 含量. 研究目的及意义 BR作为是一种发现较晚的一种植物激素，对其在植物体内的功能的重要 性是目前公认的，但其一些功能的具体作用机制还不甚清楚。 植物BR的研究主要集中于产量、品质以及植物性状的改良等。由于对 BR的合成过程的研究己经较为明朗，目前对BR的研究主要集中在BR生物合成的 调控和信号转导上，且研究对象多是集中在模式植物拟南芥、水稻等，而对于 紫花苜蓿的BR合成及信号转导方面的研究较少。 紫花苜蓿具有高产、优质、抗逆性强、蛋白质含量高和适口性好等特点，因 此，对紫花苜蓿进行BR的分子生物学研究意义十分重大。 2 基因分析 DWF4基因的基本信息：紫花苜蓿中没有该基因登录号 物种 GeneID 拉丁名 登录号 长度 拟南芥 824229 Arabidopsis thaliana NM_001339479.1 2092 玉米 100191562 Zea mays XM_008669815.3 2052 胡杨 105110409 Populus euphratica NM_001304313.1 1672 陆地棉 107896149 Gossypium hirsutum NM_001326836.1 1565 紫花苜蓿 Medicago sativa