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第二章 环境中的微生物 第一节 微生物类群与生物三域 一、微生物及其类群 二、生物三域特征 生物分类单元 分类单元-界、门、纲、目、科、属、种。 生物分类的基本单元是种。 种以下可再分为亚种、变种、型和菌株等。 对生物究竟分几界的问题，在人类发展历史上有一个由浅入深，由简至繁，由低级到高级的认识过程。 近100多年，从两界经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统，最后又出现三原界系统。 二界系统：植物界、动物界 三界系统：植物界、动物界、原生生物界 四界系统：植物界、动物界、原始生物界（原生动物、真菌、部分藻类）、菌界（细菌、蓝细菌） 五界系统：动物界、植物界、原生生物界、真菌界、原核生物界 三原界系统：古细菌原界、真细菌原界、真核生物原界 第二节 真细菌 细菌：有时泛指全部原核微生物，有时专指原核微生物中的真细菌，有时候仅指真细菌中一部分微生物。 真细菌是人类研究得最多的一类原核生物。 球菌(coccus) 球菌(coccus) 球菌(coccus) 球菌(coccus) 球菌(coccus) 杆菌的形态多样 自然界中杆菌最常见，球菌次之，而螺旋菌最少。 （二）细菌的染色 由于细菌的细胞极其微小又十分透明，因此用水浸片或悬滴观察法在光学显微镜下进行观察时，只能看到大体形态和运动情况。 若要在光学显微镜下观察其形态和主要构造，一般都要对它们进行染色。 细菌染色方法 革兰氏染色法 该染色法由丹麦医生C.Gram于1884年创立。 分为初染、媒染、脱色和复染四步。 革兰氏染色的意义 通过这一染色，可把几乎所有的细菌分成革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌两个大类。因此是分类鉴定的重要指标。 这两类细菌在细胞结构、成分、形态、生理、生化、遗传、免疫、生态和药物敏感性等方面都呈现出明显的差异，因此任何细菌只要先通过很简单的革兰氏染色，即可提供不少其他重要的生物学特性方面的信息。 革兰氏染色机理 1.与细菌等电点有关 革兰氏阳性菌的等电点为pH2~3，革兰氏阴性菌的等电点为pH4~5。革兰氏阳性菌的等电点比革兰氏阴性菌低，说明革兰氏阳性菌带的负电荷比革兰氏阴性菌多。它们与草酸铵结晶紫的结合力大，用碘-碘化钾媒染后，两者的等电点均得到降低，但革兰氏阳性菌的等电点降低的多，故与草酸铵结晶紫结合得更牢固，对乙醇脱色的抵抗力更强。 2.与细胞壁有关 革兰氏阳性菌的脂类物质的含量很低，肽聚糖的含量高。革兰氏阴性菌相反，用乙醇脱色时，革兰氏阴性菌的脂类物质被乙醇溶解，增加细菌细胞壁的孔径及其通透性，乙醇容易进入细胞内将草酸铵结晶紫和碘-碘化钾复合物提取出来，使菌体呈现无色。 革兰氏阳性菌由于脂类物质含量极低，而肽聚糖含量高，乙醇既是脱色剂又是脱水剂，使肽聚糖脱水缩小细胞壁的孔径，降低细胞壁的通透性，阻止乙醇分子进入细胞，草酸铵结晶紫和碘-碘化钾的复合物被截留在细胞内而不被脱色，仍呈现紫色。 （二）原生质体 包括细胞质膜（原生质膜）、细胞质及其内含物、细胞核物质。 1.细胞质膜 紧贴细胞壁的内侧而包围细胞质的一层柔软而富有弹性的薄膜。是选择性半渗透膜。 主要化学成分：蛋白质（60~70%）、脂类（30~40%）、多糖（约2%）。 细胞质膜的生理功能 1.维持渗透压的梯度和溶质的转移； 2.细胞质膜上有合成细胞壁和形成横膈膜组分的酶，在膜的外表面合成细胞壁； 3.膜内陷形成中间体，含有细胞色素，参与呼吸作用。中间体与染色体的分离和细胞分裂有关，还为DNA提供附着点； 4.在细胞质膜上进行物质代谢和能量代谢。 5.细胞质膜上有鞭毛基粒，鞭毛由此长出，即为鞭毛提供附着点。 2.细胞质和内含物 细胞质是细胞质膜以内，除核物质以外的无色透明、粘稠的复杂胶体，亦称原生质。 主要由蛋白质、核酸、多糖、脂类、无机盐和水组成。 核糖体：由RNA和蛋白质组成，是合成蛋白质的场所。 其中RNA占60%，蛋白质占40%。大肠杆菌可以分解出三种分子质量不同的RNA，16SRNA、23SRNA和5SRNA。核糖体的沉降系数是70S（由50S和30S两个亚基组成） 3.拟核 无核膜和核仁，由DNA组成。 携带全部或部分遗传信息，它的功能是决定遗传性状和传递遗传信息，是重要的遗传物质。 （三）荚膜、粘液层和菌胶团 荚膜:某些细菌细胞壁外的一层较松厚，而且较固定的粘液性物质。不易着色，一般采用负染色法。 成分:多糖、多肽和脂类 功能: 1.保护作用：保护细菌免受干燥的影响，保护不受宿主吞噬细胞的吞噬。 2.当缺乏营养时，荚膜可被用作碳源和能源。 3.具荚膜的致病菌毒力强，失去荚膜的致病力下降。 4.废水生物处理中的细菌荚膜有生物吸附作用，将废水中的有机物、无机物及胶体吸附在细菌体表面上。 有些细菌不产生荚膜，其细胞仍可分泌粘性的多糖，疏松地附着在细菌细胞壁表面，与外界没有明显的