棉纤维发育突变体SSR标记定位和遗传相似性分析-生物化学与分子生物学专业毕业论文.docxVIP

摘要本研究应用传统遗传学方法，分析了新纤维发育突变体GZnn的遗传方式，确定了GZnn是 摘要 本研究应用传统遗传学方法，分析了新纤维发育突变体GZnn的遗传方式，确定了GZnn是 受一对隐性基因控制的质量性状。并利用SSR分子标记技术将该光子基因定位到10号染色体上， 与已经发现的光子Nl(位于12号染色体)’n2(位于26号染色体)所在染色体不一样，鉴于美国近年新 发现了r13光子基因，故将我们发现的新的隐性光子基因命名为114，该光予基因与分子标记slocl 紧密连锁，距离为10．8eM，而距sloe2．I位点为20．4 cM。 利用Mapmaker exp／3．0软件，对TM．1 XGZrm的F2代筛选到的22个多态性SSR等位位点 进行连锁图谱的构建，结果有12个多态性SSR等位位点分布到2个连锁群上，全长198．4 cM， 运用winQTLcart 2．0软件，采用复合区间作图法，对TM-1×GZrm的F2代衣分、子指、纤维长 度、整齐度、比强度、伸长率、马克隆值等7个数量性状进行全基因组的QTL扫描，取LOD值 为3．0时，分别发现了一个与子指有关的微效QTL(S[02)和一个与纤维长度有关的微效QTL (FL02)，可解释的表型方差变异分别为4．64％和0．19％，并将FL02和S102都定位于第12号染色 体上。 对三组不同纤维发育突变体的近等基因系，利用SSR分子标记技术，进行了分子水平上的多 态性分析及遗传相似性和聚类分析，并分类构建了这些纤维发育突变体的SSR指纹图谱。结果表 明新乡小吉无絮与中棉12的相似系数是o．471，与豫棉4号的相似系数是o．587，二者差异明显 达到显著水平，初步认为新乡小吉无絮可能来源于豫棉4号：徐州142无絮(XZl42w)和新乡 小吉无絮(Xin)突变体表型变异相同，两且，两个无绒无絮突变体SSR标记的遗传相似性达90 ％，然而，SSR指纹图谱表明两个突变体具有不同的分子特征，可能是由不同的遗传背景所致； SSR遗传相似性分析还表明四个近等基因系GZnn、H154、GZNn与TM．1的相互间差异明显(相 似系数范围为0．5．0．62)，这说明基因显隐性的突变差异可以导致较大的遗传差异。两个隐性纤维 发育突变体H一154与GZnn的相似系数达到了o．94，这与纤维性状的表现及其遗传方式极其符合， 这说明具有相同的表现型也具有一定的遗传相似性。 采用NTSYS 1，8数据分析软件对TM-1、GZnn、H-154、GZNn、XZl42w和Xin六个种质进 行了聚类分析，并绘制品种亲缘关系树状图。在距离为3的时候，这六个种质聚为三类：GZNn、 H154、GZnn聚为一支，三个品种均表现为无短绒有长纤维．与三者问有共同的血缘相吻合；而 同为无短绒无长纤维的突变体Xin与XZl42w聚为一支，表现为相同遗传表型的种质聚在一起， 说明SSR标记技术可以获得很好的按表型聚类的品种聚类图。 关键词：棉纤维发育突变体，SSR标记，指纹图谱，QTL定位 AbstractThe Abstract The new fiber mutant GZnn was analyzed using traditional genetic method and it was sure that GZnn was qualitative trait controlled by one recessive gene．Using SSR molecular marker technology, we located this gone on c}1romosome 10．Since its position was different from N1(on chromosome 12)， n2(on chromosome 26)and 113 that was found recently in America，we named it n4．The gone was closely linked with marker slocl and their distance was 10．8 cM．The gane was also linked with sloc2．1 with meir distance of20．4 cM． 22 loci were found after SSR screening the F2 ofTM-1×GZun．Using software Mapmaker exp 3．0 we found 12 ofthem were distributed on 2 linkage populations that covered 198．4 cM．Using software WinQTLea