卵巢癌对顺铂类药物耐药性的相关分析-天津医药.PDFVIP

1108 TianjinMedJ,October2015,Vol.43No.10 卵巢癌对顺铂类药物耐药性的相关分析 张玉琪，邢丽，汪涛 摘要：目的 筛选影响卵巢癌顺铂耐药性的靶点基因。方法 从GEO数据库中下载对顺铂敏感和产生抗药性 的人类卵巢癌细胞基因表达谱和甲基化谱数据（GSE15709），利用R的相关工具包筛选A2780和A2780/DDP（顺铂 耐药卵巢癌细胞系）两类卵巢癌细胞之间的差异表达和差异甲基化的基因；使用DAVID数据库对差异表达基因进 行功能富集分析；对同时发生了差异甲基化、差异表达且甲基化水平、表达水平的变化趋势相反的基因，进一步利用 qRT-PCR技术检测这些基因在两种卵巢癌细胞中的表达值。结果 研究发现在两种卵巢癌细胞之间发生了416个 差异表达和281个差异甲基化的基因，这些差异表达基因主要富集于细胞周期、核分裂和蛋白修饰负调控等生物过 程。此外，细胞周期、DNA复制和p53等通路在这些基因中同样富集。共发现4个发生了差异甲基化、差异表达且 甲基化变化水平、表达水平变化趋势相反的基因，qRT-PCR实验验证了这些基因在两种卵巢癌细胞中的表达水平。 结论 利用生物信息学和分子生物学相结合的方法，可以筛选出部分影响卵巢癌对顺铂抗药性的基因，为进一步揭 示其中的分子机制提供实验参考。 关键词：顺铂；卵巢肿瘤；计算生物学；逆转录聚合酶链反应；qRT-PCR；A2780；A2780/DDP 中图分类号：R737.31 文献标志码：A DOI：10.11958/j.issn.0253-9896.2015.10.006 Theanalysisofcisplatinresistanceinovariancancertreatment ZHANGYuqi,XINGLi,WANGTao TianjinCentralHospitalofGynecologyObstetrics,Tianjin300100,China Abstract：Objective Toscreenthetargetgenesthatcontributetocisplatinresistanceinovariancancertreatment. Methods Geneexpressionandmethylationprofilesofovariancancercellsthatweresensitiveorresistanttocisplatinwith accessionnumberGSE15709weredownloadedfromGEOdatabase.Differentialexpressedandmethylatedgeneswereidenti⁃ fiedthroughassociatingpackagesinR.DAVIDdatabasetoscreentheenrichedGOtermsandpathwaysofthedifferentex⁃ pressedgenesbetweenA2780 andA2780/DDP.GeneSetEnrichmentAnalysis(GSEA)ofdifferentgenewasperformed againstDAVIDdatabase.Genesthatexhibiteddifferenceinbothexpressionandmethylationprofilesbetweenthetwotypes ofovariancancercellsaswellasgenesthatpresentcontradictoryprofilebetweenexpressionandmethylationwereverified viaqRT-PCR.Results Wefound416differentexpressedgenesand281methylatedgenesbetweenthetwotypesofovari⁃