利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱-蔬菜学专业毕业论文.docxVIP

赵湘：利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱 赵湘：利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱 三 中文摘要 大白菜原产我国，是我国栽培面积最大的蔬菜作物。构建高密度分子遗传图 谱对于基因组结构研究、比较基因组学研究、重要基因(性状)的精细定位和图 位克隆等具有重要意义。芜菁为十字花科芸薹属芸薹种芜菁亚种能形成肉质根的 二年生草本植物，具有很多重要的遗传特性，特别是晚抽薹特性为春夏大白菜品 种的选育提供了优异的基因源。构建白菜×芜菁的分子遗传图谱，不仅可以定位 并利用芜菁的晚抽薹基因，而且为研究白菜叶球形成和根茎膨大等特性奠定基础。 本研究以结球白菜BY(Brassica rapa ssp．pelunensis)和芜菁MM(B．rapa ssp．rapifera) 杂交后代F1进行小孢子培养获得的80个DH株系为试材，在前期研究的基础上， 进一步增加稳定、可靠的InDel和SSR标记，构建一张高密度的InDel和SSR的 结球白菜×欧洲芜菁图谱，以便进行该图谱与参考图谱的比较研究，在此基础上 有可能将该图谱锚定于白菜全基因组序列，为重要性状的精细定位和分子克隆奠 定基础。 l-本实验选用了265对SSR引物和400对InDel引物，用DH群体的父母本 和Fl代进行多态性分子标记筛选。265对SSR引物经过PCR扩增、电泳分析，其 中87对引物获得了预期PCR产物，在作图群体的双亲间表现多态，条带清晰，重 复性好，多态率为32．8％。400对InDel引物中，96对引物获得了预期PCR产物， 在双亲间表现多态，多态率为24％。这些标记分布于白菜的lO个连锁群，为白菜 InDel和SSR图谱的构建奠定了良好基础。 2．利用筛选获得的87对SSR引物和96对InDel引物进行分离分析，并整合 已有的55个SSR标记，构建了包含10个连锁群、202个标记位点的分子连锁图 谱，图谱总长度925．7cM，标记间的平均图距为4．7 cM，每个连锁群上的标记数为 14-28个，平均图距在3．2--一8．1 cM之间，连锁群长度介于66．1～113．3 cM。该图 谱为结球白菜和芜菁重要性状的遗传定位奠定了良好基础。 3．在定位的202个标记中， 5％显著水平上有U 1个标记不符合孟德尔分离 比例，表现偏分离，比率为54．9％。在所有的偏分离标记中，偏向母本BY的有 79个，占71．2％，偏向父本MM的有32个，占28．8％。 2 2 扬州大学硕士学位论文 4．本实验筛选获得的183个多态性标记中，4个标记位点BRNS．043、 BRU00756、syau—m08和BrlDl0351在DH群体中出现了新的等位变异，变异主要 发生在SSR重复序列中，主要表现为基元的重复次数变异：4个标记位点的等位 变异频率分布于28．75％-一32．5％之间。 关键词：大白菜：芜菁；遗传图谱；SSR；InDel 赵湘：利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱 赵湘：利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱 三 Abstract Chinese cabbage(Brassica rapa ssp．pekinensis)is one of the most important vegetable crops in China．A detailed genetic linkage map offer the possibility of developing genetic studies on various agronomic traits through the localization of major genes and quantitative trait Ioci(QTLs)，helping breeding programs、)l，itll marker-assisted(MAS)，as well as for comparative genomics and map-based cloning． Cruciferae Brassica turnip is the biennial herbs plant which Call form a fleshy tool埘t11 a lot of important genetic characteristics，in particular the character of the late bolting which provides excellent breeding genetic source for breeding late spring and summer cabbage varieties．Constrution of a molecu