SmallRNA-seq数据分析流程_上海丰核信息科技有限公司.docxVIP

________________________________________________________________________ 上海丰核 SCI论文发表，基金申请，实验外包 4000-331-887 sRNA-seq技术及数据分析宣传画册 一、sRNA-seq技术概览 小RNA测序技术（Small RNA-seq，sRNA-seq）是针对短链非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）的实验结合高通量测序技术，用于检测样本内部小RNA的表达水平。其实验部分主要包含小RNA的样本制备和深度测序（Deep Sequencing）两个部分。 1、小RNA提取的基本实验步骤 （1）小RNA条带的获得和cDNA制备； （2）扩增后准备测序 2、深度测序部分 当我们准备好片段化的DNA样本后，需要通过专业的高通量reads测序仪进行碱基读取的步骤。之后把这些reads回贴到到已知的sRNA序列或参考染色体序列上从检测sRNA的表达水平以及对潜在的未知sRNA转录位置进行预测。 二、sRNA-seq数据的生物信息学分析流程展示 sRNA-seq数据的生物信息学分析步骤包括：测序饱和度估计、测序后reads的质控和筛选、clean reads比对、基因表达水平计算、样本组间差异表达基因的检测、癌症样本RNA-seq数据