三种鮡科鱼类线粒体全基因组的测定及鮡科鱼类系统发育分析-渔业资源专业论文.docxVIP

华中农业大学2016届硕士研究生学位(毕业)论文2．结果与分析 华中农业大学2016届硕士研究生学位(毕业)论文 2．结果与分析 ．．38 2．1序列分析 。38 2．2系统发育分析 。45 2．3分子钟估算 。52 3．讨论 ．．54 3．1觥科鱼类系统发育讨论 ．．54 3．2觥科鱼类分化时间讨论 ．．56 参考文献 58 硕士在读期间发表的论文 ．．66 致谢 ．．67 万方数据 三种鱿科鱼类线粒体全基因组的测定及鱿科鱼类系统发育分析摘要 三种鱿科鱼类线粒体全基因组的测定及鱿科鱼类系统发育分析 摘要 扎那纹胸觥(Glyptothorax zainaensis)和穴形纹胸觥(Glyptothorax cavia) 隶属于鲇形目(Siluriformes)、觥科(Sisoridae)、纹胸觥属(Glyptothorax)， 贡山觥(Pareuchiloglanis gongshanensis)隶属于鲇形目(Siluriformes)、觥科 (Sisoridae)、觥属(Pareuchiloglanis)。本文通过测定上述三种觥科鱼类线粒 体全基因组序列，并联合NCBI中下载的11属12种觥科鱼类线粒体全基因组数 据，利用Cyt b基因和COXl基因，重建觥科鱼类系统发育关系，并利用beast 软件估算觥科鱼类分化时间，主要结果如下： 1．扎那纹胸觥线粒体基因组全长16537b