基于结构的虚拟筛选和Maestro的使用教程.pptVIP

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2019-05-18 发布于安徽
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基于结构的虚拟筛选与Maestro的使用朱孔凯 2015-7-22 药物发现面临的挑战化学空间 1020 类药化合物生物空间 104 ~ 105 蛋白药物发现先导化合物药靶正确的小分子 + 正确的药靶高通量筛选VS虚拟筛选优点：可进行大规模（上百万分子）筛选。缺点：费钱；有些体系不适合；命中率低。晶体结构已知未知基于配体的方法基于结构的方法分子对接已有活性化合物相似性搜索药效团模型机器学习没有活性化合物常用的分子对接程序有DOCK，AutoDOCK，Glide，Gold等。 Maestro 登陆：（Putty、Xshell） Maestro is the graphical user interface (GUI) for all Schrödinger software. Prime---蛋白质结构预测； Glide---配体-受体分子对接； Liaison---预测结合与亲和力； Qsite---研究蛋白质活性区域内的反应机制(QM/MM)； Phase---作基于配体的药效建模； QikProp---用于候选药物的ADME性状预测； LigPrep---用于小分子配体的准备； Epik---对生物环境中的配体质子化状态做精确枚举； Jaguar---高性能初始量子力学组件； MacroModel---应用于材料及生命科学等的化学研究； Strike---用于检查组织性能关系的化学方法统计程序；分子对接(Glide) 分析对接结果 Applications Glide XP visualizer 导出来用 Pymol 看谢谢！谢谢！放映结束感谢各位观看！让我们共同进步